Integrated genomic and epigenomic analyses of pediatric solid tumors utilizing adaptive sampling

• Project/Area Number: 24K18569
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 渡邉 健太郎 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (20645006)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2024: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
• Keywords: ゲノム解析 / エピゲノム解析 / 小児がん / アダプティブサンプリング / ロングリードシークエンス

Outline of Research at the Start

本研究は、ナノポア技術によるロングリード解析を応用したアダプティブサンプリングが迅速・柔軟・網羅的なゲノム・エピゲノム解析を実現しうることに着目し、小児固形がんに対する統合的な解析系を確立することを目的とする。解析パイプラインの最適化を図るとともに、予後予測や治療選択を実現する礎となる知見を蓄積する。最終的には小児固形がんの診断と治療選択の速度と精度を引き上げ、治療成績の向上に寄与することを目指す。