日本人大腸がん患者における深層学習を用いた新規融合遺伝子の探索と機能の解明

Research Project

Project/Area Number	24K18580
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
Research Institution	Hiroshima University
Principal Investigator	末廣智也広島大学, 医系科学研究科(歯), 特任助教 (60981735)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000) Fiscal Year 2025: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000) Fiscal Year 2024: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords	融合遺伝子 / 大腸がん
Outline of Research at the Start	1000症例を超える日本人大腸がん患者のRNA-seqデータから、未知の融合遺伝子を検出する。近年大腸がんではNTRK融合遺伝子を標的とする分子標的薬が日本で採択されたが、がん遺伝子パネル検査では適用となる症例は少ない。また大規模な融合遺伝子検出は海外のみであり、日本人大腸がん患者から高頻度の新規融合遺伝子を同定出来れば、臨床レベルで応用可能な治療標的として期待できる。本研究ではCIRCULATE-Japanより供与された日本人大腸がん患者のRNA-seqデータから新規融合遺伝子を検出し、AlphaFold2を用いたタンパク質構造予測とin vitro、in vivo実験から臨床応用を目指す。