腫瘍内遺伝子変異不均一性に対応した超高感度ctDNAモニタリング方法の開発

• Project/Area Number: 24K18586
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
• Research Institution: Iwate Medical University
• Principal Investigator: 開 勇人 岩手医科大学, 医歯薬総合研究所, 助教 (50847358)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2026: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2025: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2024: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
• Keywords: crDNA / リキッドバイオプシー / がん / 腫瘍内遺伝子変異不均一性

Outline of Research at the Start

血中循環腫瘍DNA（circulating tumor DNA, ctDNA）は、汎用性の高い新たな腫瘍マーカーとして期待されている。申請者らは、独自のプライマー・プローブライブラリを含む超高感度個別化デジタルPCR（dPCR）による定量系を確立した（特許第6544783号）。一方、腫瘍内遺伝子変異不均一性の観点から、モニタリングできる遺伝子変異数が限られるdPCRでは、どの遺伝子変異をモニタリング対象とするかが非常に重要である。本研究では、臓器横断的および遠隔転移/腹膜播種など再発形式の異なる約800症例を用いて、追跡対象遺伝子変異の選定アルゴリズムを構築・検証する。