Establishment of an intronic variant evaluation system aimed at improving the diagnosis rate of mitochondrial disease.

• Project/Area Number: 24K18898
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 52050:Embryonic medicine and pediatrics-related
• Research Institution: Juntendo University
• Principal Investigator: 八塚 由紀子 順天堂大学, 大学院医学研究科, 助教 (20458524)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2026: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000); Fiscal Year 2025: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2024: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
• Keywords: ミトコンドリア病 / 遺伝子診断 / スプライシング異常 / イントロニックバリアント / ミニジーンアッセイ

Outline of Research at the Start

臨床的にミトコンドリア病が強く疑われ、精力的な遺伝子解析を続けているにも関わらず、未診断となっている症例が複数存在する。解決すべき問題点として、イントロン領域のスプラインシング関連バリアントは従来のゲノム配列解析を主とする解析手法では抽出できない、患者由来RNAにアクセス出来ず検証が進まない、といった点が挙げられる。
本研究は、患者皮膚由来線維芽細胞が未樹立であってもイントロン領域のVUSがスプライシングに及ぼす影響を検証できるような2つの解析系（①全血RNAを解析試料とするRNAシーケンス、②患者由来試料を用いないミニジーンアッセイ）を確立し、遺伝子診断未解決の症例に解決策を与えるものである。