Does the integration of the hepatitis B virus (HBV) genome into host cells generate extrachromosomal DNA and lead to hepatocellular carcinoma?

Research Project

Project/Area Number	24K18935
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 53010:Gastroenterology-related
Research Institution	Chiba University
Principal Investigator	兒島隆太千葉大学, 医学部附属病院, 医員 (60836609)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2025: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000) Fiscal Year 2024: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords	B型肝炎 / 肝細胞癌 / 染色体外環状DNA / integration
Outline of Research at the Start	B型肝炎による肝癌発生のメカニズムはまだ十分に解明されていない。近年、B型肝炎ウイルス（HBV）のDNAが組み込まれることで染色体外DNA（ecDNA）が発生し、がん遺伝子のコピー数が増幅する可能性が示唆されている。私たちは、HBVの組み込みとコピー数の増幅が確認された肝癌細胞株を対象に、NanoporeロングリードシーケンスおよびFISH法を用いて、ecDNAの検出とHBVを含むDNA領域の配列決定を行う。これにより、コピー数増幅のメカニズムやecDNAの機能を解明することを目指す。また、B型肝炎陽性の肝細胞癌の臨床サンプルを用いてecDNAの発生を検出し、その臨床的意義を検討する。