新規メタゲノム解析法による糞便中の薬剤耐性大腸菌クローンのポピュレーション解析

Research Project

Project/Area Number	24K19263
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
Research Institution	Kyoto University
Principal Investigator	津田裕介京都大学, 医学研究科, 医員 (40977758)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000) Fiscal Year 2026: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000) Fiscal Year 2025: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000) Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords	大腸菌 / 薬剤耐性 / 腸内細菌叢
Outline of Research at the Start	腸管内では、様々なSequence Type（ST）を示す異なる大腸菌株が混在し、薬剤耐性（Antimicrobial resistance: AMR）と関連が強い特定のSTがAMR遺伝子のキャリアとなっている。しかし、糞便中のAMR大腸菌のスクリーニング検査法は定量性にかけ網羅的でないことが知られている。本研究では、新規に開発したメタゲノム解析手法により、模擬糞便検体や患者検体を用いて妥当性を検証するとともに、患者検体におけるAMR関連STの腸管保菌状況を明らかにする。本研究の結果により、AMR大腸菌の伝播メカニズムの解明、さらには効果的な感染対策の立案も期待される。