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実験科学研究の効率化のための能動学習と転移学習手法の開発

Research Project

Project/Area Number 24K20836
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 61030:Intelligent informatics-related
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

松井 孝太  名古屋大学, 医学系研究科, 講師 (50737111)

Project Period (FY) 2024-04-01 – 2028-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2027: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2026: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords転移学習 / 適応的実験計画 / 能動学習
Outline of Research at the Start

本研究では高コストなデータ収集フェイズがしばしばボトルネックとなる実験科学領域において,転移学習と能動学習によって効率的な実験を実現することを目指す.特に医学領域や材料科学領域の問題を対象として,新たなドメインで効率的に実験を行うために,過去データを効果的に利用して現在のドメインで高い性能が得られることが予想される条件に対して適応的にラベル付けを行うことを可能にする能動学習アルゴリズムを開発する.

Outline of Annual Research Achievements

本年度は,主に転移学習と適応的実験計画それぞれの手法開発とその評価,医学や材料科学領域への適用を行い,また得られた成果の対外発表,論文および書籍の執筆を行った.具体的には以下の4つの項目について取り組んだ.
(1)転移学習の書籍執筆を行った.本書は転移学習の枠組みの説明からはじめ,転移学習の理論やさまざまな問題設定への拡張,適用方法を高いレベルで習得できる内容となっている.
(2)トランスフォーマーモデルの文脈内学習が自動ドメイン適応機能を有していることを示唆する理論的な保証を与え,ICML WS(https://iclworkshop.github.io/)で発表を行った.
(3)転移学習の材料科学領域への展開として,(a) マルチモーダルな情報から高分子の物性を予測するための特徴転移の方法開発,(b) 第一原理計算のシミュレーションデータと実際の実験データを統合して触媒活性予測を行うためのsim2realデータ変換手法の開発を行い,それぞれNeurIPS WS(https://sites.google.com/view/ai4mat/ai4mat-neurips-2024)で発表を行った.これらの結果は査読付き論文誌に投稿し,(b) については既に出版されている.
(4)がん第一相臨床試験における最大耐用量推定問題に対して,能動的レベル集合推定に基づく新しい試験デザインを提案し,シミュレーションでの評価に加えて,理論的な収束の保証を与えた.この結果は査読付き論文誌に投稿中である.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は,実験研究を効率化するための2つの軸として据えていた転移学習と適応的実験計画について,それぞれ方法論研究および応用研究で成果が得られた.また,書籍の執筆を通して転移学習という方法論のアウトリーチを広く行うことができたと認識している.
トランスフォーマーの文脈内学習は,多数の研究によってさまざまなアルゴリズムを(パラメータを変更するという意味での)学習を行うことなく近似できる機能が示されている.本年度得られた成果では,文脈内学習がドメイン適応の主要なアルゴリズムの近似機能をも有していることが示され,これは文脈内学習の原理の解明に貢献するものであると考えられる.
材料科学領域への展開で得られた成果は,材料科学領域で実際に頻出する問題(高分子の物性予測,触媒活性予測)を効率化するものである.さらに,本研究で提案したフレームワークは,研究内で扱ったものとは異なる物質・材料へも比較的簡単に適用することができる拡張性の高さも有している.これは,材料科学領域全体に資する成果であると考えることができる.
さらに,がん第一相試験に対する成果では,アルゴリズムの開発とシミュレーションでの評価だけでなく,理論的な収束解析も行っており,医学と機械学習という分野を橋渡しする成果になっていると考えられる.
以上のように,転移学習および適応的実験計画の方法開発と理論的研究について,また実問題を取り扱う応用研究および方法論のアウトリーチについて,おおむね順調に進んでいると判断することができる.

Strategy for Future Research Activity

本年度の活動では,転移学習と適応的実験計画の研究それぞれにおいて大きな進展が得られた.今後の展開として,(1)転移学習と適応的実験計画の方法論の拡張と応用,(2)両者を能動的転移学習の方法として統合することを考えている.
(1)について,まず転移学習では,事前学習モデルが学習済み隠れ表現の上にタスク固有層をレイヤードする「軽量ファインチューニング」を軸に,マルチモーダルデータを扱うためのドメイン不変表現学習を深化させる.適応的実験計画では,物質固有の情報や,患者個人の状態を条件として取り込むことができる文脈付きベイズ最適化に注目し,臨床試験デザインなどへ拡張可能なアルゴリズム開発を目指す.
(2)続いて,両者を結節する能動的転移学習の枠組みを実装し,ソース領域の獲得関数をターゲット領域の情報価値に応じて動的に重み付けするアルゴリズムの開発を目指す.材料科学領域では高分子物性予測や触媒活性予測,医学領域では第I/II相臨床試験の用量探索問題をケーススタディとし,シミュレーションと実データ解析の両面で手法の評価を行う.

Report

(1 results)
  • 2024 Research-status Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2025 2024

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Evaluating treatment effect modifiers using data from randomized two-sequence, two-period crossover clinical trials: application to a diabetes study2025

    • Author(s)
      Emoto Ryo、Igeta Masataka、Matsui Kota、Ishii Kiyoaki、Takamura Toshinari、Matsui Shigeyuki
    • Journal Title

      Journal of the Royal Statistical Society Series C: Applied Statistics

      Volume: - Issue: 3 Pages: 1-16

    • DOI

      10.1093/jrsssc/qlae072

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Establishment of a machine learning model for predicting splenic hilar lymph node metastasis2025

    • Author(s)
      Ishizu Kenichi、Takahashi Satoshi、Kouno Nobuji、Takasawa Ken、Takeda Katsuji、Matsui Kota、Nishino Masashi、Hayashi Tsutomu、Yamagata Yukinori、Matsui Shigeyuki、Yoshikawa Takaki、Hamamoto Ryuji
    • Journal Title

      npj Digital Medicine

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1038/s41746-025-01480-x

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transfer learning from first-principles calculations to experiments with chemistry-informed domain transformation2025

    • Author(s)
      Yahagi Yuta、Obuchi Kiichi、Kosaka Fumihiko、Matsui Kota
    • Journal Title

      Machine Learning: Science and Technology

      Volume: 6 Issue: 2 Pages: 025026-025026

    • DOI

      10.1088/2632-2153/adcdc0

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 転移学習の基本概念と統計的学習理論からの視点2024

    • Author(s)
      松井孝太
    • Organizer
      日本ロボット学会第154回ロボット工学セミナー「数理に基づく学習とその応用」
    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Automatic Domain Adaptation by Transformers in In-Context Learning2024

    • Author(s)
      Ryuichiro Hataya, Kota Matsui, Masaaki Imaizumi
    • Organizer
      1st ICML Workshop on In-Context Learning
    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Sim2Real transfer for catalyst activity prediction2024

    • Author(s)
      Yuta Yahagi, Kiichi Obuchi, Fumihiko Kosaka, Kota Matsui
    • Organizer
      NeurIPS 2024 Workshop on AI for Accelerated Materials Design (AI4Mat)
    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Multi-modal cascade feature transfer for polymer property prediction2024

    • Author(s)
      Kiichi Obuchi, Yuta Yahagi, Kiyohiko Kosaka, Shukichi Tanaka, Kota Matsui
    • Organizer
      NeurIPS 2024 Workshop on AI for Accelerated Materials Design (AI4Mat)
    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] レベルセット推定の停止基準2024

    • Author(s)
      石橋英朗, 松井孝太, 沓掛健太朗, 日野英逸
    • Organizer
      第38回人工知能学会全国大会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] 転移学習を用いたヒストリカルコントロールデータの動的利用2024

    • Author(s)
      松井孝太, 大東智洋, 土田潤, 坂巻健太郎
    • Organizer
      2024年度統計関連学会連合大会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] 推定された密度比を用いる重要度重み付け共変量シフト適応の再考2024

    • Author(s)
      加藤真大, 松井孝太, 井口亮
    • Organizer
      第27回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2024)
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] インコンテキスト学習におけるTransformerの自動ドメイン適応2024

    • Author(s)
      幡谷龍一郎, 松井孝太, 今泉允聡
    • Organizer
      第27回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2024)
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      2024 Research-status Report
  • [Presentation] 臨床試験における過去データ適応的利用のための重要度重み付き推定法2024

    • Author(s)
      松井孝太, 大東智洋, 金森敬文, 土田潤, 坂巻顕太郎
    • Organizer
      第27回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2024)
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] Sim2Real転移学習による触媒活性予測2024

    • Author(s)
      矢作裕太, 小渕喜一, 高坂文彦, 松井孝太
    • Organizer
      第27回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2024)
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] Multi-modal cascade feature transfer for polymer property prediction2024

    • Author(s)
      小渕喜一, 矢作裕太, 當山清彦, 田中修吉, 松井孝太
    • Organizer
      第27回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2024)
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Book] 転移学習2024

    • Author(s)
      松井孝太,熊谷亘
    • Total Pages
      416
    • Publisher
      講談社
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 高分子向けの転移学習(事前学習済モデル活用)に関する機械学習システム2024

    • Inventor(s)
      松井孝太,小渕喜一,矢作裕太,當山清彦
    • Industrial Property Rights Holder
      東海国立大学機構
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2024
    • Related Report
      2024 Research-status Report

URL: 

Published: 2024-04-05   Modified: 2025-12-26  

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