Understanding cell metabolism lineages by developing metabolomics and its informatics techniques

• Project/Area Number: 24K21269
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
• Research Institution: Tokyo University of Agriculture and Technology
• Principal Investigator: 津川 裕司 東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (30647235)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 宮本 潤基 東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (20805668) ; 露崎 弘毅 千葉大学, 大学院医学研究院, 特任講師 (70769520)
• Project Period (FY): 2024-06-28 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥26,000,000 (Direct Cost: ¥20,000,000、Indirect Cost: ¥6,000,000); Fiscal Year 2026: ¥7,800,000 (Direct Cost: ¥6,000,000、Indirect Cost: ¥1,800,000); Fiscal Year 2025: ¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000); Fiscal Year 2024: ¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000)
• Keywords: メタボローム / 質量分析 / 細胞系譜解析 / インフォマティクス

Outline of Research at the Start

本研究では、マウス発生過程のメタボローム変容を細胞レベルで可視化するための質量分析情報計測基盤の構築を行う。また、その作用機序を解明するため、シングルセルRNA-seqや空間トランスクリプトームデータを統合する数理手法を構築し、遺伝子―代謝物の細胞系譜解析を行える基盤構築を行う。この手法を用い本研究では動物の臓器発生過程および生後の成長過程で起こる劇的な代謝・転写の変容点を細胞レベルで同定し、胎児期（母体環境）や生後直後の栄養状態が成熟後の臓器機能に影響するメカニズムの解明を試みる。