Constructing an in vivo High-Resolution Cell Lineage Analysis System Utilizing Cellular Barcoding Technology

• Project/Area Number: 24K21302
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 57:Oral science and related fields
• Research Institution: Okayama University
• Principal Investigator: 大野 充昭 岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (60613156)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 窪木 拓男 岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (00225195) ; 王 紫儀 岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (71000113)
• Project Period (FY): 2024-06-28 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥26,000,000 (Direct Cost: ¥20,000,000、Indirect Cost: ¥6,000,000); Fiscal Year 2026: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000); Fiscal Year 2025: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000); Fiscal Year 2024: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000)
• Keywords: DNAバーコード / scRNA-seq / 間葉系幹細胞

Outline of Research at the Start

本研究は，これまでの技術では不可能とされてきた組織発生時の不均質な細胞集団の分化過程とその系譜を解明することを目的に，細胞バーコーディング技術とspatial RNA-seq解析技術を統合し，細胞のバーコード情報と発生過程の細胞の位置情報を元に細胞を1細胞レベルで正確に追跡して解析することが可能な『in vivo高解像度細胞系譜解析システム』の構築を行う．さらに，バイオインフォマティクスの専門知識がない研究者でも簡便に解析が可能な，汎用性の高い解析ソフトウエアを開発する．