栄養繁殖性作物における微量ウイルスの高感度トラッキングと発病予測への応用

Research Project

Project/Area Number	24K21865
Research Category	Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
Research Institution	Tokyo University of Agriculture and Technology
Principal Investigator	小松健東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (60451837)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	神戸敏成龍谷大学, 農学部, 教授 (00393108)
Project Period (FY)	2024-06-28 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2026: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000) Fiscal Year 2025: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000) Fiscal Year 2024: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords	植物ウイルス / 栄養繁殖性作物 / オオバコモザイクウイルス / デジタルPCR
Outline of Research at the Start	感染初期のごく微量のウイルスをいかに捉えるかは発病予測と感染拡大の防止に重要である。しかし、地下部の複数年栽培が必要な栄養繁殖性の作物では、塊茎や球根（鱗茎）からの高純度の核酸の抽出が困難でRT-qPCRは非特異増幅を生じやすく、微量のウイルスの定量が難しい。本研究では、ユリとそれに壊疽症状を示すオオバコモザイクウイルス（PlAMV）に焦点を当て、鱗茎養成の複数の段階及び異なる組織におけるPlAMV量を磁気ビーズによる高純度なRNA抽出法とデジタルPCRにより定量する。これにより、感染初期の微量ウイルスが栄養繁殖性植物で増殖・発病する過程を解明し、数理モデルによる発病予測に応用する。