Establishment of genomic pathology based tumor subtyping system for solid cancers by single cell spatial transcriptome sequencing

• Project/Area Number: 24K22164
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 56:Surgery related to the biological and sensory functions and related fields
• Research Institution: Nagoya University
• Principal Investigator: 赤松 秀輔 名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (20767248)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 都築 豊徳 愛知医科大学, 医学部, 教授 (70627645) ; 後藤 崇之 京都大学, 医学研究科, 講師 (90806605)
• Project Period (FY): 2024-06-28 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000); Fiscal Year 2026: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2025: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2024: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
• Keywords: 前立腺癌 / 単一細胞遺伝子発現解析 / 空間遺伝子発現解析

Outline of Research at the Start

本研究では固形癌の中でも特に微小領域内でヘテロながん細胞集団が頻繁に共存しかつ、それらの異なる細胞集団の臨床的意義がはっきりしている前立腺癌をモデルとしてXeniumを用いた単一細胞空間遺伝子発現解析を行い、従来の形態に基づく病理診断では反映できなかった細胞の特性を加味した、より深層的かつ客観性が高い新たな「ゲノム病理学的な分化度分類」の構築を目指す。さらに、特に治療抵抗性の低分化な細胞群に特徴的な遺伝子発現や微小環境の特性から新たな治療標的を同定し新規の治療開発を目指す。