Understanding the Mechanisms of Tooth Germ Development Using Spatial Single-Cell Epigenome Analysis

• Project/Area Number: 24K22188
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 57:Oral science and related fields
• Research Institution: Okayama University
• Principal Investigator: 窪木 拓男 岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (00225195)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 大野 充昭 岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (60613156) ; 王 紫儀 岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (71000113)
• Project Period (FY): 2024-06-28 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2026: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2024: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
• Keywords: 歯 / 発生 / RNA-seq

Outline of Research at the Start

本研究では，歯胚発生における運命決定メカニズムを解明することを目的に，歯胚発生初期のマウス歯胚および非歯原性口腔粘膜組織を単離し，snRNA/ATAC-seqにて1細胞エピゲノム解析を行う．また，位置情報を有したspatial RNA-seqにて解析し，間葉細胞と相互作用を起こしている上皮細胞群が特異的に発現している転写因子を抽出し，snRNA/ATAC-seqの結果と照らし合わせて関連転写因子を絞り込む．そして，オルガノイド技術を応用することで，口腔粘膜組織から歯胚発生を誘導可能な転写因子，つまり歯胚発生における運命決定転写因子を同定を試みる．