深層生成モデルとFEP法を用いた創薬応用基盤の構築

Research Project

Project/Area Number	24K22340
Research Category	Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields
Research Institution	University of Hyogo
Principal Investigator	尾嶋拓兵庫県立大学, 理学研究科, 准教授 (70749316)
Project Period (FY)	2024-06-28 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000) Fiscal Year 2024: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Keywords	創薬応用計算 / 深層生成モデル / 自由エネルギー摂動法 / 分子動力学シミュレーション
Outline of Research at the Start	タンパク質とリガンドの結合親和性の予測は計算化学の中心的な課題の一つであり、創薬への応用が長年期待されている。その中でも自由エネルギー摂動法(FEP)は結合親和性を高精度に予測できることが知られているが、計算コストが非常に高く、インシリコ創薬において実用化の大きな障壁となっている。本研究では、深層生成モデルの拡散モデルを用いることで、既知のリガンドのFEP計算データから未知のリガンドの結合親和性を高精度に予測する方法論を構築する。高精度だが計算コストが非常に高いFEP法の計算データの再利用性を高め、新規薬剤探索の飛躍的な効率化を目指す。