Elucidating of teratogen action based on transcriptional regulation mechanisms

• Project/Area Number: 24K23417
• Research Category: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: 0902:General internal medicine and related fields
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: 鄒 兆南 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 助教 (21000647)
• Project Period (FY): 2024-07-31 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000); Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
• Keywords: 局所オミクス / 空間レギュロミクス / 初期発生 / 先天異常

Outline of Research at the Start

母体環境に起因する胎児の形態異常の発生プロセスを解明するために、マウス初期胚をモデルとして、高グルコースなどの環境要因摂動下での胚の微小領域における、トランスクリプトームとエピゲノム解析を行う。その結果をもとに、環境要因に応答し、ROI特異的に変動する遺伝子発現とエピゲノムランドスケープを抽出する。ROI特異的な転写制御を司るマスターレギュレータを特定するために、ChIP-Atlasを活用した転写因子エンリッチメント解析を行う。