Elucidation of disease-related glycosylation patterns by developing a method for calculating glycopeptide similarity

Research Project

Project/Area Number	24K23887
Research Category	Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	1002:Human informatics, applied informatics and related fields
Research Institution	Niigata University
Principal Investigator	高橋悠志新潟大学, 医歯学系, 特任助教 (50719713)
Project Period (FY)	2024-07-31 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000) Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords	グライコプロテオミクス / アルゴリズム / アラインメント / 階層的クラスタリング
Outline of Research at the Start	がんや筋ジストロフィーなどの幅広い密接に関わっているが解析が難解である「タンパク質に対する糖鎖分子の修飾の影響」を明らかにするため、本研究では糖ペプチド分子が取りうる全ての糖鎖修飾パターン（グライコフォーム）を考慮した糖ペプチド構造同士の類似度計算手法を開発し、それに基づいて網羅的に糖ペプチド構造同士をグループ分け（階層的クラスタリング）する。これにより、疾患に関わっている糖鎖修飾パターンを明らかにすることを本研究の目的とする。