Pathophysiology of angioimmunoblastic T-cell lymphoma by single cell analysis of stromal cells

• Project/Area Number: 24KJ0514
• Research Category: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 国内
• Review Section: Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 清水 夕貴 筑波大学, 医学医療系, 特別研究員(DC1)
• Project Period (FY): 2024-04-23 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000); Fiscal Year 2026: ¥200,000 (Direct Cost: ¥200,000); Fiscal Year 2025: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000); Fiscal Year 2024: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)

Outline of Research at the Start

ヒトのAITL患者検体と正常リンパ節に対してシングルセルRNAシーケンスを行い、AITL患者検体において割合の変化が生じている間質細胞のサブクラスターを同定する。空間的トランスクリプトーム解析と多重免疫染色を用いて、シングルセルRNAシーケンスで同定した間質サブクラスターと腫瘍細胞、免疫細胞の分布を可視化し、それぞれの細胞同士の空間的関係を解析する。AITLモデルマウスのリンパ節に対してシングルセルRNAシーケンスを行い、AITL患者検体で見られた間質細胞のサブクラスターの変化が再現されているかを検証する。