The origin of extensive ancestral polymorphisms that led to adaptive radiation and parallel evolution in East African cichlids

• Project/Area Number: 24KK0141
• Research Category: Fund for the Promotion of Joint International Research (International Collaborative Research)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
• Research Institution: Institute of Science Tokyo
• Principal Investigator: 二階堂 雅人 東京科学大学, 生命理工学院, 准教授 (70432010)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中村 遥奈 総合研究大学院大学, 統合進化科学研究センター, 特別研究員 (20967632) ; 長澤 竜樹 東京科学大学, 生命理工学院, 助教 (60782828) ; 高橋 鉄美 兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 教授 (70432359)
• Project Period (FY): 2024-09-09 – 2029-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥20,930,000 (Direct Cost: ¥16,100,000、Indirect Cost: ¥4,830,000); Fiscal Year 2028: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000); Fiscal Year 2027: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000); Fiscal Year 2026: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2025: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: シクリッド / 東アフリカ三大湖 / 適応放散 / 平行進化 / 祖先多型

Outline of Research at the Start

我々は、莫大な種多様性を誇る東アフリカ産シクリッドに着目して、適応放散や平行進化の分子機構の研究を続けているが、近年では祖先多型（SGV）に解決の糸口を見いだしている。本研究計画ではまず①ごく最近に適応放散を遂げたビクトリア湖シクリッドのゲノム比較により種間で顕著に分化した「種分化候補遺伝子」を網羅的に探索・機能検証する。そして②東アフリカ産シクリッドのゲノム比較により、種分化候補遺伝子の変異の起源がSGVに由来している可能性を検証する。さらに③SGVがマラウィ湖やタンガニィカ湖を含めた東アフリカ産シクリッドの平行進化に寄与した可能性を検証する。