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Moelcular baiss for the maintenance of the epigenome and its failure

Research Project

Project/Area Number 25291078
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypePartial Multi-year Fund
Section一般
Research Field Genetics/Chromosome dynamics
Research InstitutionKinki University (2014-2015)
Kyushu University (2013)

Principal Investigator

SADO Takashi  近畿大学, 農学部, 教授 (70321601)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2015: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2014: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2013: ¥6,630,000 (Direct Cost: ¥5,100,000、Indirect Cost: ¥1,530,000)
Keywordsエピジェネティクス / ヘテロクロマチン / 不活性X染色体 / マウス / クロマチン
Outline of Final Research Achievements

We attempted to study the molecular mechanism for the maintenance of epigenetic gene regulation by SmcHD1, which was suggested to be independent of more general polycomb group proteins. SmcHD1 was initially assumed to be involved in the maintenance of the inactivated X chromosome. Knockout of both copies of Smchd1 in embryonic fibroblasts, which stably maintain the X-inactivated state, did not affected genes on the inactive X, suggesting that the X-inactivated state could be maintained in the absence of SmcHD1. SmcHD1 may rather play a role in the process of the establishment of X-inactivation by creating an appropriate chromatin environment required for the maintenance, and may be dispensable for the maintenance once such an environment was established.

Report

(4 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (44 results)

All 2015 2014 2013

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (37 results) (of which Invited: 6 results)

  • [Journal Article] A new Xist allele driven by a constitutively active promoter is dominated by Xist locus environment and exhibits the parent-of-origin effects.2015

    • Author(s)
      Amakawa Y, Sakata Y, Hoki Y, Arata S, Shioda S, Fukagawa T, Sasaki H, Sado T.
    • Journal Title

      Development.

      Volume: 142 Pages: 4299-4308

    • DOI

      10.1242/dev.128819

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An Xist Activating Antisense RNA Required for X-chromosome Inactivation.2015

    • Author(s)
      Sarkar, M., Gayen, S., Kumar, S., Maclary, E., Buttigieg, E., Hinten, M., Kumari, A., Harris, C., Sado, T., and *Kalantry, S.
    • Journal Title

      Nature comm.

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 8564-8564

    • DOI

      10.1038/ncomms9564

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  • [Journal Article] Current view of the potential roles of proteins enriched on the inactive X chromosome2014

    • Author(s)
      Nakajima, T., Sado, T.
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems

      Volume: 89 Issue: 4 Pages: 151-157

    • DOI

      10.1266/ggs.89.151

    • NAID

      130004750052

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
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    • Author(s)
      Pasque, V., Tchieu, J., Karnik, R., Uyeda, M., Dimashkie, M.S., Case, D., Papp, B., Bonora, G., Patel, S., Ho, R., Schmidt, R., McKee, R., Sado, T., Tada, T., Meissner, A. and Plath, K.
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 159 Issue: 7 Pages: 1681-1697

    • DOI

      10.1016/j.cell.2014.11.040

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    • Author(s)
      Shinagawa T, Takagi T, Tsukamoto D, Tomaru C, Huynh LM, Sivaraman P, Kumarevel T, Inoue K, Nakato R, Katou Y, Sado T, Takahashi S, Ogura A, Shirahige K, Ishii S
    • Journal Title

      Cell Stem Cell

      Volume: 14(2) Issue: 2 Pages: 217-227

    • DOI

      10.1016/j.stem.2013.12.015

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      Kagawa, N., Hori, T., Hoki, Y., Hosoya, O., Tsutsui, K., Saga, Y., Sado, T., and *Fukagawa, T.
    • Journal Title

      Chrom. Research

      Volume: in press Issue: 3 Pages: 293-303

    • DOI

      10.1007/s10577-014-9404-1

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    • Author(s)
      Sado T, Sakaguchi T
    • Journal Title

      Reproduction

      Volume: 146(4) Issue: 4 Pages: R131-R139

    • DOI

      10.1530/rep-13-0173

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      佐渡 敬
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
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      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
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      2015-12-01
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      榊原 祐樹,佐々木 裕之,Blewitt Marnie,佐渡 敬
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      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
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      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
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      2015-12-01
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      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
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      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
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      2015-12-01
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      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
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      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
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      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01
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  • [Presentation] アリル特異的ChIP-seq法によるマウス不活性化X染色体のクロマチン動態の解析2015

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      長尾 恒治,榊原 祐樹,柴田 幸子,野澤 竜介,坂口 武久,木村 宏,佐渡 敬,小布施 力史
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01
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      大石 裕晃,鵜木 元香,福田 渓,堀 恭平,前之原 章司,千葉 初音,佐渡 敬,佐々木 裕之
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01
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  • [Presentation] SmcHD1機能欠損マウス胚における X染色体不活性化2015

    • Author(s)
      榊原祐樹,Blewitt Marnie,佐々 木裕之,佐渡 敬
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
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      宮城県仙台市(東北大学)
    • Year and Date
      2015-09-24
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  • [Presentation] 部分的機能欠損Xist アレルによるX染 色体不活性化の異常2015

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      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      宮城県仙台市(東北大学)
    • Year and Date
      2015-09-24
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    • Author(s)
      佐渡 敬,酒田祐佳,尼川裕 子,保木裕子,深川竜郎,佐々 木裕之
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
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      宮城県仙台市(東北大学)
    • Year and Date
      2015-09-24
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  • [Presentation] 部分的機能欠損Xistアレルからの発現様式の組織差2015

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      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
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      第9回日本エピジェネティクス研究会
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      東京都千代田区(学術総合センター)
    • Year and Date
      2015-05-25
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      佐渡 敬
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
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      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-04-01
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  • [Presentation] アリル特異的ChIP-seq法によるマウス不活性X染色体のクロマチン動態の解明2014

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      長尾恒治,柴田幸子,野澤竜介,木村 宏,佐渡 敬,小布施力史
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川(パシフィコ横浜)
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      2014-11-25 – 2014-11-27
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      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,佐渡 敬,佐々木裕之
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      第37回日本分子生物学会年会
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      神奈川(パシフィコ横浜)
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      2014-11-25 – 2014-11-27
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  • [Presentation] ほ乳類X染色体のヘテロクロマチン化機構の理解へ向けて2014

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      佐渡 敬
    • Organizer
      第1回北陸エピジェネティクス研究会
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      石川(金沢大学)
    • Year and Date
      2014-11-18
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      酒田祐佳,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
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      ークショップ「マウス遺伝学が牽引する最先端生命科学」,日本遺伝学会第86回大会
    • Place of Presentation
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • Year and Date
      2014-09-19
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      千木雄太,佐々木裕之,佐渡 敬
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      日本遺伝学会第86回大会
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      滋賀(長浜バイオ大学)
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      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
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      日本遺伝学会第86回大会
    • Place of Presentation
      滋賀(長浜バイオ大学)
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      2014-09-17 – 2014-09-19
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  • [Presentation] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2014

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      榊原祐樹,佐々木裕之,Marnie Blewitt,佐渡 敬
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      日本遺伝学会第86回大会
    • Place of Presentation
      滋賀(長浜バイオ大学)
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      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,佐渡 敬,佐々木裕之
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      日本遺伝学会第86回大会
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      滋賀(長浜バイオ大学)
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      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
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      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
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      東京(東京大学)
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      酒田祐佳,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
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      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      東京(東京大学)
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      2014-05-25 – 2014-05-27
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      千木雄太,佐々木裕之,佐渡 敬
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      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
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      東京(東京大学)
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      2014-05-25 – 2014-05-27
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      小布施力史,長尾恒治,野澤竜介,磯部真也,佐渡 敬,木村 宏
    • Organizer
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
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      東京(東京大学)
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      2014-05-25 – 2014-05-27
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      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,前之原章司,伊川正人,佐渡 敬,佐々木裕之
    • Organizer
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      東京(東京大学)
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      2014-05-25 – 2014-05-27
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  • [Presentation] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2014

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      榊原祐樹,佐々木裕之,Marnie Blewitt,佐渡 敬
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      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
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      東京(東京大学)
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      2014-05-25
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      酒田祐佳
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      中島達郎
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      長尾 恒治,柴田 幸子,野澤 竜介,奥田 将旭,木村 宏,佐渡 敬,小布施 力 史
    • Organizer
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      Takehisa Sakaguchi, Yuko Hoki, Chikashi Obuse, Takashi Sado
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫
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Published: 2013-05-21   Modified: 2019-07-29  

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