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Construction and analyses of gene knock-out mutants collection of Bifidobacterium to understand Bifidobacterium-human symbosis

Research Project

Project/Area Number 25292048
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypePartial Multi-year Fund
Section一般
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

Suzuki Tohru  岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) KATAYAMA TAKANE  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (70346104)
FUKUDA SHINJI  慶応大学, 政策・メディア研究科, 特任准教授 (80435677)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000)
Fiscal Year 2015: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2014: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2013: ¥7,540,000 (Direct Cost: ¥5,800,000、Indirect Cost: ¥1,740,000)
Keywords微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 / 逆遺伝学 / ミルクオリゴ糖 / 共生細菌 / 遺伝子
Outline of Final Research Achievements

We have constructed a mutant collection of Bifidobacterium using the gene knock-out (KO) technique, that we have established previously. Nine response regulator genes of the two-component regulatory system were knocked out by double cross-over homologous recombination. Then, the transcriptome analyses were performed. As the result one gene KO showed over x4 or 1/4 change of the gene expression level in over 70 genes. These gene are thought to concern Oxgen stress, Acid and bile tolerance and osmotic shock resistance. Thus, we concluded that this gene should be a master switch gene of the symbiosis with animal gut in Bifidobacterium.

Report

(4 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2015 2014

All Presentation (7 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Presentation] Bifidobacterium longum NCC2705 株における線毛関連遺伝子の破壊2015

    • Author(s)
      高橋真裕子、滝口裕加、野村泉、鈴木徹
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年大会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県、岡山市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] LEGOmid:シャトルベクターを用いないプラスミドのビルディングブロック再構成2015

    • Author(s)
      鈴木 徹、野村 泉、滝口裕加
    • Organizer
      2014年度 ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      神戸大学(兵庫県、神戸市)
    • Year and Date
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ビフィズス菌由来の新規ラクト-N-ビオシダーゼの同定と機能解析2014

    • Author(s)
      櫻間晴子、清原正志2、芦田 久、北岡本光、高橋里美、山本憲二、片山高嶺
    • Organizer
      第15回 関西グライコサイエンスフォーラム
    • Place of Presentation
      大阪市立大学(大阪府、豊中市)
    • Year and Date
      2014-05-24
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Bifidobacterium longum NCC2705株における双方向性マーカーを用いたマーカーレス遺伝子破壊法2014

    • Author(s)
      桝谷尚慶、梅村敦子、坂口広大、鈴木徹
    • Organizer
      2015年度日本乳酸菌学会泊まり込みセミナー(那須)
    • Place of Presentation
      那須オオシマフォーラム(栃木県、那須町)
    • Year and Date
      2014-05-08 – 2014-05-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Bifidobacteriumにおける系統的遺伝子破壊株コレクションの構築2014

    • Author(s)
      鈴木徹, 桝谷尚慶, 滝口裕加, 和泉絢子, 坂口広大
    • Organizer
      ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      東京農大
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Bifidobacterium. longum NCC2705株における二成分制御系遺伝子の系統的破壊株コレクション2014

    • Author(s)
      和泉 絢子,桝谷 尚慶, 滝口 裕加, 山中 祐二, 坂口 広大, 野村 泉, 鈴木 徹
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      明治大学
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Eggerthella sp. YY7918株でのダイゼイン-エクオール変換に関する酵素の解析2014

    • Author(s)
      川田 結花, 横山 慎一郎, 野村 泉, 服部 正平, 大島 健志朗, 鈴木 徹
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      明治大学
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2013-05-21   Modified: 2019-07-29  

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