森林資源保全のための樹木DNAバーコードの充実と精度の向上に関する研究

• Project/Area Number: 25292098
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Partial Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Forest science
• Research Institution: Forestry and Forest Products Research Institute
• Principal Investigator: 吉村 研介 国立研究開発法人 森林総合研究所, その他部局等, 研究員 (30353915)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 勝木 俊雄 独立行政法人森林総合研究所, 多摩森林科学園, 主任研究員 (10353640) ; 吉丸 博志 独立行政法人森林総合研究所, 多摩森林科学園, 園長 (20353914) ; 能城 修一 独立行政法人森林総合研究所, 木材特性研究領域, チーム長 (30343792) ; 山本 節子(鈴木節子) (山本 節子 / 鈴木 節子) 独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 主任研究員 (70456622)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2016-03-31
• Project Status: Adopted (Fiscal Year 2015)
• Budget Amount: ¥16,770,000 (Direct Cost: ¥12,900,000、Indirect Cost: ¥3,870,000); Fiscal Year 2015: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000); Fiscal Year 2014: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000); Fiscal Year 2013: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
• Keywords: 分類形質 / 遺伝育種 / DNAバーコード / 日本産樹木

Outline of Annual Research Achievements

DNA バーコードとは、短いDNA 配列情報で、種の同定を行う手法であり、樹木のいかなる部位（葉、材、根、花粉など）からでもDNA が抽出できて、樹種の特定が出来るDNA バーコード情報の構築を目指している。これまで、森林総研と東北大学との共同による木材標本、さく葉標本、さらに大学演習林などに協力して収集した標本等、7000個体、1039種のさく葉標本とそのDNA を収集している。
ユニバーサルなプライマーが無く、解析が困難な葉緑体DNA のmatK 部分遺伝子領域を、累計で747種3500サンプル明らかにした。しかしながら実験に困難を伴うため、新たなプライマーを開発してテスト中である。DNA バーコードの種の識別能力は、rbcL部分配列では45.1%、trnH-psbA で68.8%、matK で65.7% であった。3領域を併せると、日本産樹木では77%程度の種識別が出来る。その結果、ブナ科、クスノキ科などでは、属を識別するのも困難な分類群が存在することが明らかとなった。
標本の個体情報および塩基配列情報は、JBOLI（Japanese Barcode of Life Initiative）が一員であるCBOL（Consortium for the Barcodeof Life）が運営する国際的なデータベースシステムBOLD（Barcode of Life Data Systems）に入力されており、一部の情報は、DNAバーコードデータベース (JBOL-DB)によって公開されている。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Presentation] 日本産樹木DNAバーコードの分解能 (2015)
  • Author(s): 吉村研介、鈴木節子、勝木俊雄、能城修一,吉丸博志
  • Organizer: 日本森林学会大会
  • Place of Presentation: 北海道大学
  • Year and Date: 2015-03-28
• [Presentation] 日本産樹木DNAバーコードからみたクスノキ科、カバノキ科の特徴 (2014)
  • Author(s): 吉村研介、鈴木節子、勝木俊雄、吉丸博志
  • Organizer: 森林遺伝育種学会大会
  • Place of Presentation: 東京大学
  • Year and Date: 2014-11-07
• [Presentation] DNA barcoding on Japanese woody plants (2014)
  • Author(s): Kensuke Yoshimura, Suzuki Setsuko, Toshio Katsuki, Shuichi Noshiro, Hiroshi Yoshimaru
  • Organizer: Center for Environmental Biology and Ecosystem Studies, National Institute for Environmental Studies Symposium
  • Place of Presentation: 国立環境研究所
  • Year and Date: 2014-09-19
• [Presentation] 日本産樹木DNAバーコードによるニレ科､クワ科の種同定)
  • Author(s): 吉村研介､鈴木節子､勝木俊雄､吉丸博志
  • Organizer: 森林遺伝育種学会
  • Place of Presentation: 東京大学
• [Presentation] 日本産樹木ＤＮＡバーコーディング - 2012年度 －
  • Author(s): 吉村研介､鈴木節子､田中孝尚､鈴木三男､神保宇嗣､伊藤元己､舘田英典､大谷雅人､勝木俊雄､津村義彦､能城修一､河原孝行､吉丸博志
  • Organizer: 日本森林学会大会
  • Place of Presentation: 大宮ソニックシティ市民ホール