Research on genetic diversity of native horses in mountainy ranges of South Asia

• Project/Area Number: 25304046
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Partial Multi-year Fund
• Section: 海外学術
• Research Field: Integrative animal science
• Research Institution: Okayama University
• Principal Investigator: KUNIEDA TETSUO 岡山大学, 環境生命科学研究科, 教授 (80178011)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): YOKOYAMA Satoshi 名古屋大学, 環境学研究科, 教授 (30363518) ; MANNEN Hideyuki 神戸大学, 農学研究科, 教授 (20263395)
• Research Collaborator: TOZAKI Teruaki 公益財団法人競走馬理化学研究所, 専門役
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2017-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2016)
• Budget Amount: ¥18,070,000 (Direct Cost: ¥13,900,000、Indirect Cost: ¥4,170,000); Fiscal Year 2015: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000); Fiscal Year 2014: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000); Fiscal Year 2013: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
• Keywords: 在来馬 / 遺伝的多様性 / 東南アジア / ミトコンドリアDNA / Y 染色体 / マイクロサテライトマーカー / 国際研究者協力 / ベトナム / 在来家畜 / 馬 / 国際研究者交流 / ラオス / ミャンマー / 毛色 / ミトコンドリアDN

Outline of Final Research Achievements

In the present study we investigate genetic diversity and relation of Asian native horse populations using DNA samples collected from mountainy ranges Myanmar, Laos, and Vietnam. We collected 184, 71, and 167 DNA samples of native horses in Myanmar, Laos, and Vietnam, respectively, and investigated haplotypes of mitochondrial DNA and Y chromosomal markers as well as genotypes of microsatellite markers and several functional genes. The results indicated that genetic diversities of maternal lineages are high in these populations and the have unique genetic compositions, while a part of these populations showed genetic influences of western breeds in paternal lineage.

Research Products

• [Int'l Joint Research] 国立獣医科学大学(ミャンマー)
• [Int'l Joint Research] 国立農林研究所(ラオス)
• [Int'l Joint Research] フエ農林大学(ベトナム)
• [Int'l Joint Research] 国立獣医科学大学(ミャンマー)
• [Int'l Joint Research] 国立農林研究所(ラオス)
• [Int'l Joint Research] フエ農林大学(ベトナム)
• [Journal Article] Genotype distribution and allele frequencies of the genes associated with body composition and locomotion traits in Myanmar native horse. (2016)
  • Author(s): Okuda Y, Moe HH, Moe KK, Shimizu Y, Nishioka K, Shimogiri T, Mannen H, Kanemaki M, Kunieda
  • Journal Title: Animal Science Journal Volume: 88 Pages: 1-5
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Low mitochondrial DNA diversity of Japanese Polled and Kuchinoshima feral cattle. (2016)
  • Author(s): Mannen H, Yonesaka R, Noda A, Shimogiri T, Oshima I Katahira K, Kanemaki M, Kunieda T, Inayoshi Y, Mukai F, Sasazaki S.
  • Journal Title: Animal Science Journal Volume: 88 Pages: 739-744
  • NAID: 120006601534
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] 高密度SNPアレイを用いた口之島野生化牛の全常染色体及び各染色体に対する遺伝的多様性の評価 (2016)
  • Author(s): 齊藤祐也、笹崎晋史、下桐猛、印牧美佐生、国枝哲夫、万年英之
  • Journal Title: 日本畜産学会報 Volume: 87 Pages: 219-226
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Allelic frequencies and association with carcass traits of six genes in local subpopulations of Japanese Black cattle. (2016)
  • Author(s): Nishimaki, T., Ibi, T.,Siqintuya, Kobayashi, N., Matsuhashi, T., Akiyama, T., Yoshida, E., Imai, K., Matsui, M., Uemura, K.,, Eto, H., Watanabe, N., Fujita, T., Saito, Y., Komatsu, T., Hoshiba, H., Mannen, H., Sasazaki, S., Kunieda, T.
  • Journal Title: Anim. Sci. J. Volume: 87 Pages: 469476-469476
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] 岡山県固有の黒毛和種希少系統の遺伝学的特徴の解析 (2016)
  • Author(s): 米田一裕、奥田ゆう、斯琴図雅、西牧孝洋、松本大和、宮崎義之、揖斐隆之、辻 岳人、国枝哲夫
  • Journal Title: 日本畜産学会報 Volume: 87 Pages: 110-110
  • NAID: 130005139626
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Allelic frequencies and association with carcass traits of six genes in local subpopulations of Japanese Black cattle. (2015)
  • Author(s): Nishimaki, T., Ibi, T.,Siqintuya, Kobayashi, N., Matsuhashi, T., Akiyama, T., Yoshida, E., Imai, K., Matsui, M., Uemura, K.,, Eto, H., Watanabe, N., Fujita, T., Saito, Y., Komatsu, T., Hoshiba, H., Mannen, H., Sasazaki, S., Kunieda, T
  • Journal Title: Anim. Sci. J. Volume: 86
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] 口之島牛集団における経済形質、遺伝性疾患および毛色に関連する遺伝子の対立遺伝子頻度とその分布 (2014)
  • Author(s): 斯琴図雅、西牧孝洋、揖斐隆之、辻 岳人、米田一裕、大島一郎、片平清美、万年英之、下桐 猛、印牧美佐生、国枝哲夫
  • Journal Title: 動物遺伝育種研究 Volume: 42 Pages: 1119-1119
  • NAID: 130004680139
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] The assessment of genetic diversity within and among the eight subpopulations of Japanese Black cattle using 52 microsatellite markers. (2013)
  • Author(s): Nishimaki, T., Ibi, T., Tanabe, Y., Miyazaki, Y., Kobayashi, N., Matsuhashi, T., Akiyama, T., Yoshida, E., Imai, K., Matsui, M., Uemura, K., Watanabe, N., Fujita, T., Saito, Y., Komatsu, T., Yamada, T., Mannen, H., Sasazaki, S., Kunieda, T.
  • Journal Title: Anim. Sci. J. Volume: 62 Issue: 8 Pages: 585-591
  • DOI: 10.1111/asj.12045
  • Peer Reviewed
• [Presentation] カザフスタン在来家畜とその近縁種の遺伝資源学的国際共同研究の概要 (2017)
  • Author(s): 西堀正英、伊藤文香、竹内佳子、大西諒貴、山本義雄、黒澤弥悦、木村利花子、高橋幸水、野村こう、角田健司、山縣高宏、国枝哲夫、万年英之、Maratbek Zh Suleimenov、Meldelokov Alyan、A. Kazmrat、S.B. Bibigul、Meirat Bakhtin、Polat Kazymbet
  • Organizer: 日本畜産学会第121回大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2017-03-27
• [Presentation] カザフスタンにおける在来馬調査の概要 (2017)
  • Author(s): 国枝哲夫、江副暖子、奥田ゆう、万年英之、高橋幸水、野村こう、山縣高宏、山本義雄、角田健司、Meirat Bakhtin、Polat Kazymbet、Meldelokov Alyan、Maratbek Zh Suleimenov、Olga Safronova、西堀正英
  • Organizer: 日本畜産学会第121回大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2017-03-27
• [Presentation] カザフスタン在来牛のマイクロサテライトDNA多型 (2017)
  • Author(s): 橋幸水、田原岳、野村こう、黒澤弥悦、万年英之、山縣高宏、国枝哲夫、角田健司、山本義雄、Maratbek Zh Suleimenov、Meldelokov Alyan、Meirat Bakhtin、Polat Kazymbet、伊藤文香、竹内佳子、西堀正英
  • Organizer: 日本畜産学会第121回大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2017-03-27
• [Presentation] カザフスタン在来ヤギのマイクロサテライトDNA多型 (2017)
  • Author(s): 鈴木翔太 高橋幸水、田原岳、野村こう、黒澤弥悦、万年英之、山縣高宏、国枝哲夫、角田健司、山本義雄、Maratbek Zh Suleimenov、Meldelokov Alyan、Meirat Bakhtin、Polat Kazymbet、伊藤文香、竹内佳子、西堀正英
  • Organizer: 日本畜産学会第121回大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2017-03-27
• [Presentation] mtDNA配列を用いたカザフスタン５地域の在来ヤギの遺伝的構造の比較 (2017)
  • Author(s): 田端里彩、高橋幸水、野村こう、山縣高宏、山本義雄、角田健司、国枝哲夫、伊藤文香、竹内佳子、Meirat Bakhtin、Polat Kazymbet、Meldelokov Alyan、Maratbek Zh Suleimenov、西堀正英、笹崎晋史、万年英之
  • Organizer: 日本畜産学会第121回大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2017-03-27
• [Presentation] 見島牛・口之島牛および黒毛和種のウシ主要組織適合遺伝子領域のリシークエンスによる比較解析 (2016)
  • Author(s): 竹嶋伸之輔、細道一善、万年英之、国枝哲夫、印牧美佐生、下桐猛、間陽子
  • Organizer: 日本動物遺伝育種学会第17回大会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2016-11-05
• [Presentation] カザフスタン在来馬の遺伝学的解析 (2016)
  • Author(s): 江副暖子、奥田ゆう、Polat Kazymbet、Meirat Bakhtin、Meldelokov Alyan、Maratbek Zh Suleimenov、西堀正英、山本義雄、万年英之、山縣高宏、高橋幸水、野村こう、角田健司、国枝哲夫
  • Organizer: 日本動物遺伝育種学会第17回大会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2016-11-05
• [Presentation] ラオスのセキショクヤケイにおける遺伝的多様性と類縁関係 (2016)
  • Author(s): 山本義雄、奥田ゆう、Soukanh Keonouchanh、 Bounthong Bouahom、国枝哲夫
  • Organizer: 日本畜産学会第120回大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2016-03-28
• [Presentation] Myanmar, Laos およびVietnam 在来家畜の遺伝学的調査 (2016)
  • Author(s): 国枝 哲夫、奥田ゆう
  • Organizer: 日本動物遺伝育種学会・在来家畜研究会合同シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2016-03-27
  • Invited
• [Presentation] ミトコンドリアDNAおよびY染色体マーカーを用いたラオス在来馬の遺伝学的解析 (2015)
  • Author(s): 奥田ゆう、濱田秀一、山本義雄、Bounthavone Kounnavongsa、Soukanh Keonouchanh、Bounthong Bouahom、国枝哲夫
  • Organizer: 第16回日本動物遺伝育種学会大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2015-10-07
• [Presentation] ミャンマー在来馬の遺伝学的特徴の解析 (2015)
  • Author(s): 奥田ゆう、青木実菜、Moe Hla Hla、Moe Kyaw Kyaw、西岡謙二、清水佑起、戸崎晃明、栫裕永、万年英之、下桐猛、印牧美佐生、国枝哲夫
  • Organizer: 日本畜産学会第119回大会
  • Place of Presentation: 宇都宮
  • Year and Date: 2015-03-27 – 2015-03-29
• [Presentation] ミャンマー在来牛を用いたBos taurus 由来DNAマーカーの遺伝子型判定. (2014)
  • Author(s): Hla Hla Moe、奥田ゆう、Moe Lwin、Kyaw Kyaw Moe、河邊弘太郎、岡本新、印牧美佐生、万年 英之、国枝 哲夫、下桐 猛
  • Organizer: 第15回日本動物遺伝育種学会大会
  • Place of Presentation: 和光
  • Year and Date: 2014-10-30 – 2014-11-01
• [Presentation] 口之島牛のウシ主要組織適合遺伝子複合体領域の（MHC）領域のゲノム多様性 (2014)
  • Author(s): 竹嶋伸之輔、細道一善、菊屋真理、Polat Meripet、下桐猛、印牧美佐生、万年英之、国枝哲夫、間陽子
  • Organizer: 第15回日本動物遺伝育種学会大会
  • Place of Presentation: 和光
  • Year and Date: 2014-10-30 – 2014-11-01
• [Presentation] ウシ主要組織適合遺伝子複合体領域の（MHC）領域のゲノム多様性 (2014)
  • Author(s): 細道一善、竹嶋伸之輔、下桐猛、印牧美佐生、万年英之、国枝哲夫、井上逸朗、間陽子
  • Organizer: 第15回日本動物遺伝育種学会大会
  • Place of Presentation: 和光
  • Year and Date: 2014-10-30 – 2014-11-01
• [Presentation] mtDNA塩基配列を用いた口之島野生化牛、日本短角種、無角和種の遺伝的多様性解析 (2013)
  • Author(s): 米坂 陸、下桐 猛、稲吉洋裕、印牧美佐生、国枝哲夫、向井文雄、笹崎晋史、万年英之
  • Organizer: 日本動物遺伝育種学会第14回大会
  • Place of Presentation: 東京海洋大学
• [Presentation] 口之島牛のおける各種遺伝子の対立遺伝子頻度の調査 (2013)
  • Author(s): 斯琴図雅、下桐 猛、印牧美佐生、大島一郎、片平清美、万年英之、国枝哲夫
  • Organizer: 日本動物遺伝育種学会第14回大会
  • Place of Presentation: 東京海洋大学
• [Book] 動物遺伝育種学 (2017)
  • Author(s): 祝前博明、国枝哲夫、野村哲郎、万年英之
  • Total Pages: 204
  • Publisher: 朝倉書店