Production of new macrolide based on ribosome engineering

• Project/Area Number: 25350964
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Biomolecular chemistry
• Research Institution: Shizuoka University
• Principal Investigator: Kodani Shinya 静岡大学, 農学部, 助教 (20510621)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2016-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2015)
• Budget Amount: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000); Fiscal Year 2015: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2014: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2013: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
• Keywords: マクロライド / 抗菌活性 / 放線菌 / 抗生物質 / 育種 / リボゾーム工学

Outline of Final Research Achievements

A new 16-membered macrolide named makinolide B was isolated from Streptomyces sp. MK-19. The structure of makinolide B was determined on the basis of 2D NMR experiments including DQF-COSY, TOCSY, HSQC, and HMBC methods. As a result of paper disk diffusion method, makinolide B showed weak antibacterial activity against Staphylococcus aureus.

Research Products

• [Journal Article] Isolation and structure determination of new siderophore albachelin from Amycolatopsis alba (2015)
  • Author(s): S. Kodani, H. Komaki, M. Suzuki, H. Hemmi, M. Ohnishi-Kameyama
  • Journal Title: Biometals Volume: 28 Issue: 2 Pages: 381-389
  • DOI: 10.1007/s10534-015-9842-z
  • NAID: 120005899352
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Structure determination of a siderophore peucechelin from Streptomyces peucetius (2015)
  • Author(s): S. Kodani, H. Komaki, M. Suzuki, F. Kobayakawa, H. Hemmi
  • Journal Title: Biometals Volume: 28 Issue: 5 Pages: 791-801
  • DOI: 10.1007/s10534-015-9866-4
  • NAID: 120005899353
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Isolation and structural determination of a new hydrophobic peptide venepeptide from Streptomyces venezuelae (2014)
  • Author(s): S. Kodani, K. Sato, H. Hemmi, M. Ohnish-Kameyama
  • Journal Title: Journal of Antibiotics Volume: 67 Issue: 12 Pages: 839-842
  • DOI: 10.1038/ja.2014.81
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Isolation and Structural Determination of Makinolide B from <i>Streptomyces</i> sp. MK-19 (2013)
  • Author(s): Michitaka HIDAKI, Mitsuru YOSHIDA, Naoto OGAWA, Shinya KODANI
  • Journal Title: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry Volume: 77 Issue: 9 Pages: 1964-1966
  • DOI: 10.1271/bbb.130204
  • NAID: 10031202753
  • ISSN: 0916-8451, 1347-6947
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ゲノムマイニングに基づくStreptomyces cattleyaの新規ラッソペプチドの単離 (2016)
  • Author(s): 小谷 真也、菅井 翔吾、亀山 眞由美
  • Organizer: 日本農芸化学会大会2016年度大会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター（札幌市）
  • Year and Date: 2016-03-28
• [Presentation] Amycolatopsis albaの生産する新規シデロフォアalbachelinの構造決定 (2015)
  • Author(s): 小谷 真也, 小牧 久幸, 鈴木 雅博, 逸見 光, 亀山 眞由美
  • Organizer: 第67回日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 城山観光ホテル（鹿児島市）
  • Year and Date: 2015-10-28
• [Presentation] 新規シデロフォアalbachelinの構造決定とその生合成遺伝子 (2015)
  • Author(s): 小谷真也, 小牧久幸, 鈴木雅博, 逸見光, 亀山眞由美
  • Organizer: 2015年度日本放線菌学会大会
  • Place of Presentation: 富山国際会議場（富山市）
  • Year and Date: 2015-09-08
• [Presentation] 放線菌Planomonospora sphaerica から得られた抗菌ペプチドの単離と構造決定 (2015)
  • Author(s): 小谷 真也、井上 雄斗、逸見 光、亀山 眞由美
  • Organizer: 2015年度日本農芸化学会大会
  • Place of Presentation: 岡山県岡山市、岡山大学
  • Year and Date: 2015-03-29
• [Presentation] 放線菌Streptomyces sp. OCTN84株由来ペプチドの化学分析 (2014)
  • Author(s): 小谷 真也, 鈴木 雅博, 田中 幸徳, 越智 幸三
  • Organizer: 2014年度日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 北海道札幌市、札幌コンベンションセンター
  • Year and Date: 2014-09-10
• [Presentation] 新規疎水性ペプチド venepeptide の構造決定 (2014)
  • Author(s): 小谷 真也, 佐藤 和紀, 逸見 光, 亀山 眞由美
  • Organizer: 2014年度放線菌学会大会
  • Place of Presentation: 茨城県つくば市、エポカルつくば
  • Year and Date: 2014-06-19
• [Presentation] 新規マクロライドmakinolide Bの単離と構造の決定 (2013)
  • Author(s): 小谷 真也, 肥田木 道生, 吉田 充, 小川 直人
  • Organizer: 第65回日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 広島国際会議場（広島県）
  • Invited