Sexually dimorphic gene expression in exchangeable gene trap mouse lines

• Project/Area Number: 25430092
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Laboratory animal science
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: Yoshinobu Kumiko 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 助教 (20274730)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 荒木 正健 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 准教授 (80271609)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2017-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2016)
• Budget Amount: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000); Fiscal Year 2015: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2014: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000); Fiscal Year 2013: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: 性差発現 / 可変型遺伝子トラップ法 / X-gal染色 / 表現型解析 / Elovl6遺伝子 / EGTCデータベース / Elovl6 / 遺伝子トラップ / 遺伝子発現 / 性差 / 遺伝子改変マウス / 可変型遺伝子トラップ

Outline of Final Research Achievements

We performed gene expression profiling in gene trap mouse lines and found sexual dimorphic genes. RT-PCR using cDNA of C57BL/6(B6) strain showed a slight difference between male and female in the expression of Smyd2, Tcf12 and Elovl6.
In phenotype analysis of the Elovl6 gene trap mouse, homozygous mice were born at the expected Mendelian ratio. However, body weight in homozygous mice was lower than wild-type mice and heterozygous mice, and the difference was remarkable in male. qRT-PCR using cDNA of B6 strain showed no difference between male and female in Elovl6 expression. It was suggested that there was the sexual dimorphism of Elovl6 expression in protein level.

Research Products

• [Journal Article] Endothelial CD99 supports arrest of mouse neutrophils in venules and binds to neutrophil PILRs. (2017)
  • Author(s): Goswami, D., Marz, S., Li, Y. T., Artz, A., Schafer, K., Seelige, R., Pacheco-Blanco, M., Jing, D., Bixel, M. G., Araki, M., Araki, K., Yamamura, K., Vestweber, D.
  • Journal Title: Blood in press Volume: -
• [Journal Article] Development of an efficient screening system to identify novel bone metabolism-related genes using the exchangeable gene trap mutagenesis mouse models. (2016)
  • Author(s): Kurogi S, Sekimoto T, Funamoto T, Ota T, Nakamura S, Nagai T, Nakahara M, Yoshinobu K, Araki K, Araki M, Chosa E.
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 7
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] The importance of basonuclin 2 in adult mice and its relation to basonuclin 1. (2016)
  • Author(s): Kacso, G., Ravasz, D., Doczi, J., Nemeth, B., Madgar, O., Saada, A., Ilin, P., Miller, C., Ostergaard, E., Iordanov, I., Adams, D., Vargedo, Z., Araki, M., Araki, K., Nakahara, M., Ito, H., Gal, A., Molnar, M., Nagy, Z., Patocs, A., Adam-Vizi, V. and Chinopoulos, C.
  • Journal Title: Biochemical Journal Volume: 473(20) Pages: 3463-3485
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] MiR-142 is required for Staphylococcus aureus clearance at skin wound sites via small GTPase-mediated regulation of the neutrophil actin cytoskeleton. (2016)
  • Author(s): Tanaka, K., Kim, S. E., Yano, H., Matsumoto, G., Ohuchida, R., Ishikura, Y., Araki, M., Araki, K., Park, S., Komatsu, T., Hayashi, H., Ikematsu, K., Tanaka, K., Hirano, A., Martin, P., Shimokawa, I., Mori, R.
  • Journal Title: Journal of Investigative Dermatology Volume: 137 Pages: 931-940
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] The importance of basonuclin 2 in adult mice and its relation to basonuclin 1. (2016)
  • Author(s): Vanhoutteghem A, Delhomme B, Hervé F, Nondier I, Petit JM, Araki M, Araki K, Djian P.
  • Journal Title: Mechanisms of Development Volume: Feb 29 Pages: 1-21
  • DOI: 10.1016/j.mod.2016.02.002
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Pathophysiological significance of the two-pore domain K(+) channel K2P5.1 in splenic CD4(+)CD25(-) T cell subset from a chemically-induced murine inflammatory bowel disease model. (2015)
  • Author(s): Nakakura S, Matsui M, Sato A, Ishii M, Endo K, Muragishi S, Murase M, Kito H, Niguma H, Kurokawa N, Fujii M, Araki M, Araki K, Ohya S.
  • Journal Title: Frontiers in Physiology Volume: 6 Pages: 299-299
  • DOI: 10.3389/fphys.2015.00299
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Database for exchangeable gene trap clones: Pathway and gene ontology analysis of exchangeable gene trap clone mouse lines. (2014)
  • Author(s): Araki, M., Nakahara, M., Muta, M., Itou, M., Yanai, C., Yamazoe, F., Miyake, M., Morita, A., Araki, M., Okamoto, Y., Nakagata, M., Yoshinobu, K., Yamamura, K. and Araki, K.
  • Journal Title: Develop. Growth Differ. Volume: 56 Issue: 2 Pages: 161-174
  • DOI: 10.1111/dgd.12116
  • NAID: 40019987325
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] 遺伝子トラップはlincRNA遺伝子の破壊と機能解析に有用である (2017)
  • Author(s): 中原舞,吉信公美子,古畑理樹,杉本道彦,山村研一,荒木正健,荒木喜美
  • Organizer: 平成28年度先端モデル動物支援プラットフォーム成果発表会
  • Place of Presentation: 滋賀（琵琶湖ホテル）
  • Year and Date: 2017-02-06
• [Presentation] Gene-trap mutagenesis is useful for analysis of long intergenic non-coding RNA genes in vivo. (2016)
  • Author(s): Nakahara, M., Yoshinobu, K., Furuhata, R., Kido, Y., Sugimoto, M., Yamamura, K., Araki, M., Araki, K.
  • Organizer: 第39回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2016-11-30
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップ法で作製したTmem161a欠損マウスは明らかな骨量増加を呈する (2016)
  • Author(s): 永井琢哉、関本朝久、舩元太郎、黒木修司、大田智美、中村志保子、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
  • Organizer: 第31回日本整形外科学会基礎学術集会
  • Place of Presentation: 福岡国際センター
  • Year and Date: 2016-10-13
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップ法で作製したLima1/EPLIN欠損マウスは骨芽細胞間接着異常を認め骨量減少を呈する (2016)
  • Author(s): 中村志保子、関本朝久、黒木修司、舩元太郎、大田智美、永井琢哉、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
  • Organizer: 第31回日本整形外科学会基礎学術集会
  • Place of Presentation: 福岡国際センター
  • Year and Date: 2016-10-13
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップ法を用いたlamin B receptor変異マウスは成長障害をきたす (2016)
  • Author(s): 舩元太郎、関本朝久、黒木修司、大田智美、中村志保子、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
  • Organizer: 第31回日本整形外科学会基礎学術集会
  • Place of Presentation: 福岡国際センター
  • Year and Date: 2016-10-13
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップ法を用いた骨軟骨異常を来す新規遺伝子改変マウスライブラリー構築 (2016)
  • Author(s): 黒木修司、関本朝久、舩元太郎、大田智美、中村志保子、永井琢哉、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
  • Organizer: 第31回日本整形外科学会基礎学術集会
  • Place of Presentation: 福岡国際センター
  • Year and Date: 2016-10-13
• [Presentation] 染色体特異的にクラスターを形成しているトラップ領域（CSCT13）の解析 (2016)
  • Author(s): 荒木正健、武田伊世、大賀敏範、江藤聡、中原舞、吉信公美子、荒木喜美
  • Organizer: 日本遺伝学会第88回大会
  • Place of Presentation: 三島
  • Year and Date: 2016-09-07
• [Presentation] Cre-driverマウスラインの樹立と解析 (2016)
  • Author(s): 國場訓、江藤聡、荒木美幸、森田彩香、來海葉子、山村研一、 吉信公美子、荒木喜美、荒木正健
  • Organizer: 日本遺伝学会第88回大会
  • Place of Presentation: 三島
  • Year and Date: 2016-09-07
• [Presentation] CSCT2領域(3.1Mbp)欠損マウスラインの樹立 (2016)
  • Author(s): 大賀俊範、武田伊世、江藤聡、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健
  • Organizer: 日本遺伝学会第88回大会
  • Place of Presentation: 三島
  • Year and Date: 2016-09-07
• [Presentation] ゲノム編集によるlincRNAトラップクローンの修正と解析 (2016)
  • Author(s): 吉信公美子、吉住友希、林田隆成、中原舞、荒木正健、荒木喜美
  • Organizer: 日本ゲノム編集学会
  • Place of Presentation: 広島国際会議場
  • Year and Date: 2016-09-06
• [Presentation] Gene-trap mutagenesis is useful for analysis of long intergenic non-coding RNA genes in vivo. (2016)
  • Author(s): Nakahara, M., Yoshinobu, K., Ito, H., Furuhata, R., Yamamura, K., Araki, M., Araki, K.
  • Organizer: The 2016 AMMRA & AMPC meeting
  • Place of Presentation: 箱根
  • Year and Date: 2016-05-20
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップ法を用いた骨軟骨疾患に関与する新規遺伝子群のライブラリー構築 (2016)
  • Author(s): 関本朝久、舩元太郎、黒木修司、大田智美、中村志保子、永井琢哉、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
  • Organizer: 第89回日本整形外科学会学術総会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2016-05-12
• [Presentation] lincRNAの生体内機能解析 ～遺伝子トラップマウスからのアプローチ～ (2015)
  • Author(s): 吉信 公美子、中原 舞、山村 研一、荒木 喜美、荒木 正健
  • Organizer: 第38回日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • Year and Date: 2015-12-01
• [Presentation] Gene-trap mutagenesis is useful for analysis of long intergenic non-ciding RNA genes. (2015)
  • Author(s): Nakahara, M., Yoshinobu, K., Ito, H., Furuhata, R., Yamamura, K., Araki, M. and Araki, K.
  • Organizer: the 29th Annual Conference of the International Mammalian Genome Society
  • Place of Presentation: 横浜市開港記念会館（神奈川県 横浜市）
  • Year and Date: 2015-11-08
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Correlation of lincRNA-p21 and p53 expression in the LincRNA-p21 gene trap mouse (2015)
  • Author(s): Furuhata, R., Nakahara, M., Ito, H., Yamamura, K., Araki, M. and Araki, K.
  • Organizer: the 29th Annual Conference of the International Mammalian Genome Society
  • Place of Presentation: 横浜市開港記念会館（神奈川県 横浜市）
  • Year and Date: 2015-11-08
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 染色体特異的にクラスターを形成しているトラップ領域(CSCT13)の解析 (2015)
  • Author(s): 武田 伊世、大賀 俊範、荒木 美幸、岡本 頼幸、吉信 公美子、荒木 喜美、荒木 正健
  • Organizer: 第29回モロシヌス研究会
  • Place of Presentation: かんぽの宿 有馬（兵庫県神戸市）
  • Year and Date: 2015-07-03
• [Presentation] Crd-Driverマウスラインの樹立と解析 (2015)
  • Author(s): 荒木 美幸、国場 訓、森田 彩香、岡本 頼幸、山村 研一、來海 葉子、吉信 公美子、荒木 正健、荒木 喜美
  • Organizer: 第29回モロシヌス研究会
  • Place of Presentation: かんぽの宿 有馬（兵庫県神戸市）
  • Year and Date: 2015-07-03
• [Presentation] 遺伝子トラップマウスを用いた lincRNAの生体内機能解析 (2015)
  • Author(s): 荒木 正健、中原 舞、柳井 千佳、山添 史雅、 宮家 幹子、森田 彩香、岡本 頼幸、荒木 美幸、 伊東 春香、山村 研一、吉信 公美子、荒木 喜美
  • Organizer: 第６２回日本実験動物学会
  • Place of Presentation: 京都テルサ
  • Year and Date: 2015-05-28
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップマウスの様々な組織におけるプロモーター活性解析 (2014)
  • Author(s): 吉信公美子、來海葉子、慶田貴子、古閑成美、中原舞、山村研一、荒木喜美、荒木正健
  • Organizer: 日本組織化学学会
  • Place of Presentation: 松本市中央公民館（Mウィング文化センター）
  • Year and Date: 2014-09-27 – 2014-09-28
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップマウスラインのパスウェイ解析及びジーンオントロジー解析 (2014)
  • Author(s): 荒木正健、中原舞、中潟直己、山村研一、吉信公美子、荒木喜美
  • Organizer: 日本遺伝学会第８６回大会
  • Place of Presentation: 長浜バイオ大学（滋賀県長浜市）
  • Year and Date: 2014-09-17 – 2014-09-19
• [Presentation] 遺伝子トラップマウスを用いたlincRNAの生体内機能解析 (2014)
  • Author(s): 宮家幹子、森田彩香、柳井千佳、山添史雅、中原舞、荒木美幸、岡本頼幸、伊東春香、大西雄一朗、国場訓、山村研一、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
  • Organizer: 第２８回モロシヌス研究会 ２０１４年６月２７日～２８日
  • Place of Presentation: 修善寺総合会館（静岡県伊豆市）
  • Year and Date: 2014-06-27 – 2014-06-28
• [Presentation] Establishment and analysis of Cre-driver mouse line (2014)
  • Author(s): 森田彩香、宮家幹子、荒木美幸、岡本頼幸、国場訓、大西雄一朗、山村研一、來海葉子、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
  • Organizer: 第２８回モロシヌス研究会
  • Place of Presentation: 修善寺総合会館（静岡県伊豆市）
  • Year and Date: 2014-06-27 – 2014-06-28
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップクローンデータベース[EGTC]の開発と解析 (2014)
  • Author(s): 荒木正健、中原舞、柳井千佳、山添史雅、宮家幹子、森田彩香、荒木美幸、岡本頼幸、中潟直己、吉信公美子、山村研一、荒木喜美
  • Organizer: 第６１回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター（札幌）
  • Year and Date: 2014-05-15 – 2014-05-17
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップクローンの進展
  • Author(s): 吉信 公美子，來海 葉子，慶田 貴子，古閑 成美，中原 舞，山村 研一，荒木 喜美，荒木 正健
  • Organizer: 第３６回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
• [Presentation] 遺伝子トラップマウスを用いたlincRNAの機能解析
  • Author(s): 中原 舞、山添 史雅、柳井 千佳、吉信 公美子、山村 研一、荒木 正健、荒木 喜美
  • Organizer: 第３６回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
• [Presentation] Analysis of gene-trap mouse lines trapping long non-coding RNA genes. (Part 1)
  • Author(s): 柳井 千佳、山添 史雅、中原 舞、宮家 幹子、森田 彩香、荒木 美幸、岡本 頼幸、伊東 春香、山村 研一、吉信 公美子
  • Organizer: 第２７回モロシヌス研究会
  • Place of Presentation: 筑波（理研バイオリソースセンター）
• [Presentation] 可変型遺伝子トラップクローンを利用したCre-driverマウスの作製
  • Author(s): 荒木 喜美、森田 彩香、宮家 幹子、吉信 公美子、来海 葉子、慶田 貴子、古閑 成美、中潟 直己、村上 亜弓、門田 雅世、目加田 和之、吉木 淳、荒木 正健
  • Organizer: 第６０回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 筑波（つくば国際会議場）
• [Remarks] Database for the Exchangeable Gene Trap Clones
  • URL: http://egtc.jp/action/main/index
• [Remarks] Database for the Exchangeable Gene Trap Lines
  • URL: http://egtc.jp/