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Sexually dimorphic gene expression in exchangeable gene trap mouse lines

Research Project

Project/Area Number 25430092
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Laboratory animal science
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

Yoshinobu Kumiko  熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 助教 (20274730)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 荒木 正健  熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 准教授 (80271609)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2013: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords性差発現 / 可変型遺伝子トラップ法 / X-gal染色 / 表現型解析 / Elovl6遺伝子 / EGTCデータベース / Elovl6 / 遺伝子トラップ / 遺伝子発現 / 性差 / 遺伝子改変マウス / 可変型遺伝子トラップ
Outline of Final Research Achievements

We performed gene expression profiling in gene trap mouse lines and found sexual dimorphic genes. RT-PCR using cDNA of C57BL/6(B6) strain showed a slight difference between male and female in the expression of Smyd2, Tcf12 and Elovl6.
In phenotype analysis of the Elovl6 gene trap mouse, homozygous mice were born at the expected Mendelian ratio. However, body weight in homozygous mice was lower than wild-type mice and heterozygous mice, and the difference was remarkable in male. qRT-PCR using cDNA of B6 strain showed no difference between male and female in Elovl6 expression. It was suggested that there was the sexual dimorphism of Elovl6 expression in protein level.

Report

(5 results)
  • 2016 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2015 Research-status Report
  • 2014 Research-status Report
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (36 results)

All 2017 2016 2015 2014 Other

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (27 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Endothelial CD99 supports arrest of mouse neutrophils in venules and binds to neutrophil PILRs.2017

    • Author(s)
      Goswami, D., Marz, S., Li, Y. T., Artz, A., Schafer, K., Seelige, R., Pacheco-Blanco, M., Jing, D., Bixel, M. G., Araki, M., Araki, K., Yamamura, K., Vestweber, D.
    • Journal Title

      Blood in press

      Volume: -

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    • Author(s)
      Kurogi S, Sekimoto T, Funamoto T, Ota T, Nakamura S, Nagai T, Nakahara M, Yoshinobu K, Araki K, Araki M, Chosa E.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7

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  • [Journal Article] The importance of basonuclin 2 in adult mice and its relation to basonuclin 1.2016

    • Author(s)
      Kacso, G., Ravasz, D., Doczi, J., Nemeth, B., Madgar, O., Saada, A., Ilin, P., Miller, C., Ostergaard, E., Iordanov, I., Adams, D., Vargedo, Z., Araki, M., Araki, K., Nakahara, M., Ito, H., Gal, A., Molnar, M., Nagy, Z., Patocs, A., Adam-Vizi, V. and Chinopoulos, C.
    • Journal Title

      Biochemical Journal

      Volume: 473(20) Pages: 3463-3485

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    • Author(s)
      Tanaka, K., Kim, S. E., Yano, H., Matsumoto, G., Ohuchida, R., Ishikura, Y., Araki, M., Araki, K., Park, S., Komatsu, T., Hayashi, H., Ikematsu, K., Tanaka, K., Hirano, A., Martin, P., Shimokawa, I., Mori, R.
    • Journal Title

      Journal of Investigative Dermatology

      Volume: 137 Pages: 931-940

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  • [Journal Article] The importance of basonuclin 2 in adult mice and its relation to basonuclin 1.2016

    • Author(s)
      Vanhoutteghem A, Delhomme B, Hervé F, Nondier I, Petit JM, Araki M, Araki K, Djian P.
    • Journal Title

      Mechanisms of Development

      Volume: Feb 29 Pages: 1-21

    • DOI

      10.1016/j.mod.2016.02.002

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    • Author(s)
      Nakakura S, Matsui M, Sato A, Ishii M, Endo K, Muragishi S, Murase M, Kito H, Niguma H, Kurokawa N, Fujii M, Araki M, Araki K, Ohya S.
    • Journal Title

      Frontiers in Physiology

      Volume: 6 Pages: 299-299

    • DOI

      10.3389/fphys.2015.00299

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  • [Journal Article] Database for exchangeable gene trap clones: Pathway and gene ontology analysis of exchangeable gene trap clone mouse lines.2014

    • Author(s)
      Araki, M., Nakahara, M., Muta, M., Itou, M., Yanai, C., Yamazoe, F., Miyake, M., Morita, A., Araki, M., Okamoto, Y., Nakagata, M., Yoshinobu, K., Yamamura, K. and Araki, K.
    • Journal Title

      Develop. Growth Differ.

      Volume: 56 Issue: 2 Pages: 161-174

    • DOI

      10.1111/dgd.12116

    • NAID

      40019987325

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    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 遺伝子トラップはlincRNA遺伝子の破壊と機能解析に有用である2017

    • Author(s)
      中原舞,吉信公美子,古畑理樹,杉本道彦,山村研一,荒木正健,荒木喜美
    • Organizer
      平成28年度先端モデル動物支援プラットフォーム成果発表会
    • Place of Presentation
      滋賀(琵琶湖ホテル)
    • Year and Date
      2017-02-06
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      Nakahara, M., Yoshinobu, K., Furuhata, R., Kido, Y., Sugimoto, M., Yamamura, K., Araki, M., Araki, K.
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      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2016-11-30
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    • Author(s)
      永井琢哉、関本朝久、舩元太郎、黒木修司、大田智美、中村志保子、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
    • Organizer
      第31回日本整形外科学会基礎学術集会
    • Place of Presentation
      福岡国際センター
    • Year and Date
      2016-10-13
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    • Author(s)
      中村志保子、関本朝久、黒木修司、舩元太郎、大田智美、永井琢哉、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
    • Organizer
      第31回日本整形外科学会基礎学術集会
    • Place of Presentation
      福岡国際センター
    • Year and Date
      2016-10-13
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  • [Presentation] 可変型遺伝子トラップ法を用いたlamin B receptor変異マウスは成長障害をきたす2016

    • Author(s)
      舩元太郎、関本朝久、黒木修司、大田智美、中村志保子、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
    • Organizer
      第31回日本整形外科学会基礎学術集会
    • Place of Presentation
      福岡国際センター
    • Year and Date
      2016-10-13
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  • [Presentation] 可変型遺伝子トラップ法を用いた骨軟骨異常を来す新規遺伝子改変マウスライブラリー構築2016

    • Author(s)
      黒木修司、関本朝久、舩元太郎、大田智美、中村志保子、永井琢哉、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
    • Organizer
      第31回日本整形外科学会基礎学術集会
    • Place of Presentation
      福岡国際センター
    • Year and Date
      2016-10-13
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  • [Presentation] 染色体特異的にクラスターを形成しているトラップ領域(CSCT13)の解析2016

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      荒木正健、武田伊世、大賀敏範、江藤聡、中原舞、吉信公美子、荒木喜美
    • Organizer
      日本遺伝学会第88回大会
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      三島
    • Year and Date
      2016-09-07
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  • [Presentation] Cre-driverマウスラインの樹立と解析2016

    • Author(s)
      國場訓、江藤聡、荒木美幸、森田彩香、來海葉子、山村研一、 吉信公美子、荒木喜美、荒木正健
    • Organizer
      日本遺伝学会第88回大会
    • Place of Presentation
      三島
    • Year and Date
      2016-09-07
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  • [Presentation] CSCT2領域(3.1Mbp)欠損マウスラインの樹立2016

    • Author(s)
      大賀俊範、武田伊世、江藤聡、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健
    • Organizer
      日本遺伝学会第88回大会
    • Place of Presentation
      三島
    • Year and Date
      2016-09-07
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  • [Presentation] ゲノム編集によるlincRNAトラップクローンの修正と解析2016

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      吉信公美子、吉住友希、林田隆成、中原舞、荒木正健、荒木喜美
    • Organizer
      日本ゲノム編集学会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場
    • Year and Date
      2016-09-06
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  • [Presentation] Gene-trap mutagenesis is useful for analysis of long intergenic non-coding RNA genes in vivo.2016

    • Author(s)
      Nakahara, M., Yoshinobu, K., Ito, H., Furuhata, R., Yamamura, K., Araki, M., Araki, K.
    • Organizer
      The 2016 AMMRA & AMPC meeting
    • Place of Presentation
      箱根
    • Year and Date
      2016-05-20
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 可変型遺伝子トラップ法を用いた骨軟骨疾患に関与する新規遺伝子群のライブラリー構築2016

    • Author(s)
      関本朝久、舩元太郎、黒木修司、大田智美、中村志保子、永井琢哉、中原舞、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健、帖佐悦男
    • Organizer
      第89回日本整形外科学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2016-05-12
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  • [Presentation] lincRNAの生体内機能解析 ~遺伝子トラップマウスからのアプローチ~2015

    • Author(s)
      吉信 公美子、中原 舞、山村 研一、荒木 喜美、荒木 正健
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会
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      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
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  • [Presentation] Gene-trap mutagenesis is useful for analysis of long intergenic non-ciding RNA genes.2015

    • Author(s)
      Nakahara, M., Yoshinobu, K., Ito, H., Furuhata, R., Yamamura, K., Araki, M. and Araki, K.
    • Organizer
      the 29th Annual Conference of the International Mammalian Genome Society
    • Place of Presentation
      横浜市開港記念会館(神奈川県 横浜市)
    • Year and Date
      2015-11-08
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  • [Presentation] Correlation of lincRNA-p21 and p53 expression in the LincRNA-p21 gene trap mouse2015

    • Author(s)
      Furuhata, R., Nakahara, M., Ito, H., Yamamura, K., Araki, M. and Araki, K.
    • Organizer
      the 29th Annual Conference of the International Mammalian Genome Society
    • Place of Presentation
      横浜市開港記念会館(神奈川県 横浜市)
    • Year and Date
      2015-11-08
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  • [Presentation] 染色体特異的にクラスターを形成しているトラップ領域(CSCT13)の解析2015

    • Author(s)
      武田 伊世、大賀 俊範、荒木 美幸、岡本 頼幸、吉信 公美子、荒木 喜美、荒木 正健
    • Organizer
      第29回モロシヌス研究会
    • Place of Presentation
      かんぽの宿 有馬(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-07-03
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  • [Presentation] Crd-Driverマウスラインの樹立と解析2015

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      荒木 美幸、国場 訓、森田 彩香、岡本 頼幸、山村 研一、來海 葉子、吉信 公美子、荒木 正健、荒木 喜美
    • Organizer
      第29回モロシヌス研究会
    • Place of Presentation
      かんぽの宿 有馬(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-07-03
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  • [Presentation] 遺伝子トラップマウスを用いた lincRNAの生体内機能解析2015

    • Author(s)
      荒木 正健、中原 舞、柳井 千佳、山添 史雅、 宮家 幹子、森田 彩香、岡本 頼幸、荒木 美幸、 伊東 春香、山村 研一、吉信 公美子、荒木 喜美
    • Organizer
      第62回日本実験動物学会
    • Place of Presentation
      京都テルサ
    • Year and Date
      2015-05-28
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      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 可変型遺伝子トラップマウスの様々な組織におけるプロモーター活性解析2014

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      吉信公美子、來海葉子、慶田貴子、古閑成美、中原舞、山村研一、荒木喜美、荒木正健
    • Organizer
      日本組織化学学会
    • Place of Presentation
      松本市中央公民館(Mウィング文化センター)
    • Year and Date
      2014-09-27 – 2014-09-28
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 可変型遺伝子トラップマウスラインのパスウェイ解析及びジーンオントロジー解析2014

    • Author(s)
      荒木正健、中原舞、中潟直己、山村研一、吉信公美子、荒木喜美
    • Organizer
      日本遺伝学会第86回大会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学(滋賀県長浜市)
    • Year and Date
      2014-09-17 – 2014-09-19
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 遺伝子トラップマウスを用いたlincRNAの生体内機能解析2014

    • Author(s)
      宮家幹子、森田彩香、柳井千佳、山添史雅、中原舞、荒木美幸、岡本頼幸、伊東春香、大西雄一朗、国場訓、山村研一、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
    • Organizer
      第28回モロシヌス研究会 2014年6月27日~28日
    • Place of Presentation
      修善寺総合会館(静岡県伊豆市)
    • Year and Date
      2014-06-27 – 2014-06-28
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  • [Presentation] Establishment and analysis of Cre-driver mouse line2014

    • Author(s)
      森田彩香、宮家幹子、荒木美幸、岡本頼幸、国場訓、大西雄一朗、山村研一、來海葉子、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
    • Organizer
      第28回モロシヌス研究会
    • Place of Presentation
      修善寺総合会館(静岡県伊豆市)
    • Year and Date
      2014-06-27 – 2014-06-28
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 可変型遺伝子トラップクローンデータベース[EGTC]の開発と解析2014

    • Author(s)
      荒木正健、中原舞、柳井千佳、山添史雅、宮家幹子、森田彩香、荒木美幸、岡本頼幸、中潟直己、吉信公美子、山村研一、荒木喜美
    • Organizer
      第61回日本実験動物学会総会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌)
    • Year and Date
      2014-05-15 – 2014-05-17
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  • [Presentation] 可変型遺伝子トラップクローンの進展

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      吉信 公美子,來海 葉子,慶田 貴子,古閑 成美,中原 舞,山村 研一,荒木 喜美,荒木 正健
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
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      神戸ポートアイランド
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      中原 舞、山添 史雅、柳井 千佳、吉信 公美子、山村 研一、荒木 正健、荒木 喜美
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
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      神戸ポートアイランド
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      柳井 千佳、山添 史雅、中原 舞、宮家 幹子、森田 彩香、荒木 美幸、岡本 頼幸、伊東 春香、山村 研一、吉信 公美子
    • Organizer
      第27回モロシヌス研究会
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      筑波(理研バイオリソースセンター)
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  • [Presentation] 可変型遺伝子トラップクローンを利用したCre-driverマウスの作製

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      荒木 喜美、森田 彩香、宮家 幹子、吉信 公美子、来海 葉子、慶田 貴子、古閑 成美、中潟 直己、村上 亜弓、門田 雅世、目加田 和之、吉木 淳、荒木 正健
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      筑波(つくば国際会議場)
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      http://egtc.jp/

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Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

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