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System construction of progression risk assessments of early to advanced gastric carcinomas by genomic copy-number profile

Research Project

Project/Area Number 25460454
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Human pathology
Research InstitutionShiga University of Medical Science

Principal Investigator

Sugihara Hiroyuki  滋賀医科大学, 医学部, 教授 (30171169)

Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) Mukaisho Ken-ichi  滋賀医科大学, 医学部, 准教授 (50343223)
Nakayama Takahisa  滋賀医科大学, 医学部, 助教 (90632315)
Yamamoto Hiroto  滋賀医科大学, 医学部, 特任助教 (30610654)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2013: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords胃癌 / アレイCGH解析 / 階層的クラスタリング / 定量的PCR / 進展リスク / 転移リスク / 未分化型胃癌 / TP53 / MYC
Outline of Final Research Achievements

Using basically irreversible genomic copy-number changes, we aimed to examine continuity and discontinuity of genetic lineages between early and advanced gastric carcinomas (GCs) to enable individual early stage lesions to be treated appropriately on the basis of progression risk assessments. The genomic copy-number profile of each tumor sample, detected by array-based comparative genomic hybridization, was classified by hierarchical clustering. Our data obtained suggested that ① early undifferentiated-type GCs inevitably progress to advanced stages; ② in differentiated-type GCs, part of early GCs and large part of non-invasive neoplasms never become advanced; ③ the risk of lymph node metastasis is determined stochastically and difficult to predict in earlier stages. We also extracted some genes, such as RXRB, that are useful in the prediction of progression risk.

Report

(4 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Research-status Report
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (36 results)

All 2016 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (29 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] がんをどう理解し説明するか-発癌メカニズムからリスク予知まで2016

    • Author(s)
      杉原 洋行
    • Journal Title

      京都消化器医会会報

      Volume: 32

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Journal Article] Progression risk assessments of individual non-invasive gastric neoplasms by genomic copy-number profile and mucin phenotype.2015

    • Author(s)
      Vo DT, Nakayama T, Yamamoto H, Mukaisho K, Hattori T, Sugihara H
    • Journal Title

      BMC Medical Genomics

      Volume: 8: 6 Issue: 1

    • DOI

      10.1186/s12920-015-0080-6

    • Related Report
      2014 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Genetic lineages of undifferentiated-type gastric carcinomas analysed by unsupervised clustering of genomic DNA microarray data.2013

    • Author(s)
      Sonoda A, Mukaisho K, Nakayama T, Diem VT, Hattori T, Andoh A, Fujiyama Y, Sugihara H
    • Journal Title

      BMC Medical Genomics

      Volume: 6(25) Issue: 1

    • DOI

      10.1186/1755-8794-6-25

    • Related Report
      2013 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Precursor-derived versus de-novo carcinogenesis depends on lineage-specific mucin phenotypes of intramucosal gland-forming gastric neoplasms.2013

    • Author(s)
      Nishimura R, Mukaisho KI, Yamamoto H, Sonoda A, Andoh A, Fujiyama Y, Hattori T, Sugihara H
    • Journal Title

      Histopathology

      Volume: 63 Issue: 5 Pages: 616-629

    • DOI

      10.1111/his.12208

    • Related Report
      2013 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNAコピー数プロファイルによる個々の非浸潤性胃腫瘍の進展リスク評価2016

    • Author(s)
      杉原 洋行、Vo Thi Ngoc Diem、仲山 貴永、向所 賢一、堀田 兼蔵
    • Organizer
      第105回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2016-05-12
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  • [Presentation] 胃癌のリンパ節転移リスクはゲノムコピー数プロファイルで予知できるか?2016

    • Author(s)
      Duong Thanh Tu、仲山 貴永、Vo Thi Ngoc Diem、向所 賢一、杉原 洋行
    • Organizer
      第105回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2016-05-12
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  • [Presentation] ゲノムコピー数解析による個々の非浸潤性胃腫瘍の進展リスク評価2015

    • Author(s)
      杉原 洋行、仲山 貴永、向所 賢一、服部 隆則
    • Organizer
      第26回日本消化器癌発生学会
    • Place of Presentation
      米子全日空ホテル(鳥取県・米子市)
    • Year and Date
      2015-11-19
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Progression risk assessments of individual non-invasive gastric neoplasms by genomic copy-number profile.2015

    • Author(s)
      Vo TND, Nakayama T, Yamamoto H, Mukaisho K, Hattori T, Hotta K, Otani T, Sugihara H
    • Organizer
      NCRI Cancer Conference
    • Place of Presentation
      Liverpool (UK)
    • Year and Date
      2015-11-01
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 層構造を有する未分化型胃癌の系譜解析とその進展予測2015

    • Author(s)
      堀田 兼蔵、園田 文乃、仲山 貴永、向所 賢一、杉原 洋行
    • Organizer
      第74回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2015-10-08
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  • [Presentation] Progression risk of individual non-invasive gastric neoplasms assessed by genomic copy-number profile.2015

    • Author(s)
      Vo Thi Ngoc Diem, 仲山 貴永、山本 裕人、向所 賢一、服部 隆則、Hua TN Ha、Nguyen S Trung、杉原 洋行
    • Organizer
      第74回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2015-10-08
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  • [Presentation] Pnenotypic lineage and polarity of cell proliferation in intramucosal gland-formaing gastric neoplasms2015

    • Author(s)
      向所 賢一、服部 隆則、杉原 洋行
    • Organizer
      第56回日本組織細胞化学会 総会・学術集会
    • Place of Presentation
      関西医科大学 枚方キャンパス(大阪府・枚方市)
    • Year and Date
      2015-10-03
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] がんをどう理解し説明するか-発癌メカニズムから考える-2015

    • Author(s)
      杉原 洋行
    • Organizer
      京都消化器医会学術講演会
    • Place of Presentation
      京都府医師会館
    • Year and Date
      2015-08-08
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      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Lineage analysis in intramucosal gland-forming gastric neoplasms by cluster analysis for array-based comparative genomic hybridization data2014

    • Author(s)
      Thi-Ngoc Diem Vo, Takahisa Nakayama, Ken-ichi Mukaisho, Takanori Hattori, Hiroyuki Sugihara
    • Organizer
      The 8th International Conference of the International Society of Gastroenterological Carcinogenesis
    • Place of Presentation
      ホテル日航福岡(福岡)
    • Year and Date
      2014-11-12 – 2014-11-14
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Common fragile sitesのhomozygous deletionからみた胃癌の系譜解析2014

    • Author(s)
      仲山貴永、向所賢一、山本裕人、Vo T Duem、園田文乃、杉原洋行
    • Organizer
      第25回日本消化器癌発生学会総会
    • Place of Presentation
      ホテル日航福岡(福岡)
    • Year and Date
      2014-11-12 – 2014-11-14
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 層構造を伴う胃印環細胞癌の系譜と初期からみられる進展のサイン2014

    • Author(s)
      杉原洋行,園田文乃、仲山貴永、Vo T Duem、向所賢一
    • Organizer
      第73回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Parallel genetic lineages rather than single sequence in progression of gland-forming neoplasms of the stomach2014

    • Author(s)
      Diem Thi-Ngoc Vo, Takahisa Nakayama, Ken-ichi Mukaisho, Takanori Hattori, Hiroyuki Sugihara
    • Organizer
      第73回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 胃癌のアレイCGH解析におけるFHIT homozygous deletionの系譜特異性2014

    • Author(s)
      仲山貴永、向所賢一、山本裕人、Vo T Duem、園田文乃、杉原洋行
    • Organizer
      第73回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
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      2014 Research-status Report
  • [Presentation] ゲノムレベルと発現レベルの系譜解析による早期癌の進展リスク予測2014

    • Author(s)
      杉原洋行
    • Organizer
      第39回組織細胞化学講習会
    • Place of Presentation
      ピアザ淡海(大津市)
    • Year and Date
      2014-08-06 – 2014-08-07
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      2014 Research-status Report
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  • [Presentation] Lineage analysis by aCGH data and mucin phenotypic expression in non-invasive gastric neoplasms2014

    • Author(s)
      Vo DT, Nakayama T, Mukaisho K, Hattori T, Sugihara H
    • Organizer
      第103回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場(広島市)
    • Year and Date
      2014-04-24 – 2014-04-26
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  • [Presentation] アレイCGHによるDNAコピー数変化に基いた胃粘膜内癌の組織型による進展リスクの評価2014

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      仲山貴永、Vo T Duem、山本裕人、園田文乃、向所賢一、服部隆則、杉原洋行
    • Organizer
      第103回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場(広島市)
    • Year and Date
      2014-04-24 – 2014-04-26
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  • [Presentation] DNAマイクロアレイデータのクラスタリングによる未分化型胃癌の系譜解析

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      園田 文乃、向所 賢一、仲山 貴永、Vo TN Diem、服部 隆則、杉原 洋行
    • Organizer
      第102回日本病理学会総会
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      札幌芸文館、札幌市
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      2013 Research-status Report
  • [Presentation] 胃癌におけるFHITのhomozygous deletionについてのarray CGHおよびqPCRによる検討

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      仲山 貴永、向所 賢一、山本 裕人、Vo TN Diem、園田 文乃、服部 隆則、杉原 洋行
    • Organizer
      第102回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      ロイトン札幌、札幌市
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      2013 Research-status Report
  • [Presentation] Cluster analysis of array CGH data for the assessment of metastasis risk in gastric adenocarcinomas

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      Vo TN Diem、仲山 貴永、向所 賢一、杉原 洋行
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      第102回日本病理学会総会
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      ロイトン札幌、札幌市
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  • [Presentation] 胃分化型腺癌におけるFHITのhomozygous deletionおよびタンパク発現についての検討

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      仲山 貴永、向所 賢一、山本 裕人、Vo TN Diem、杉原 洋行
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      第24回日本消化器癌発生学会総会
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      金沢県立音楽堂、金沢市
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  • [Presentation] 早期および進行期分化型胃がんにおける系譜解析 (4) 染色体脆弱部位のhomozygous deletion

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      仲山 貴永、向所 賢一、山本 裕人、Vo TN Diem、杉原 洋行
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      第72回日本癌学会学術総会
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      パシフィコ横浜、横浜市
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  • [Presentation] DNAマイクロアレイデータのクラスタリングによる未分化型胃癌の系譜解析

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      園田 文乃、向所 賢一、仲山 貴永、Vo TN Diem、服部 隆則、藤山 佳秀、杉原 洋行
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      第72回日本癌学会学術総会
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      パシフィコ横浜、横浜市
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  • [Presentation] 分化型胃癌の高転移性のリスクを反映する遺伝子のスクリーニング

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      Vo TN Diem、仲山 貴永、向所 賢一、杉原 洋行
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      第72回日本癌学会学術総会
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      パシフィコ横浜、横浜市
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      2013 Research-status Report
  • [Presentation] Genetic lineages of early and advanced undifferentiated-type gastric carcinomas analyzed by clustering of genomic DNA microarray data.

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      Hiroyuki Sugihara, Ayano Sonoda, Ken-ichi Mukaisho, Takahisa Nakayama, Vo Thi Ngoc Diem, Akira Andoh, Yoshihide Fujiyama, Takanori pattori
    • Organizer
      The 4th JCA-AACR Special Joint Conference
    • Place of Presentation
      東京ベイ舞浜ホテル クラブリゾート, 浦安市
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  • [Presentation] Array CGH-based screening of genes carrying high metastatic risk in tuublar adenocarcinoma of the stomach.

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      Thi-Ngoc Diem Vo, Takahisa Nakayama, Ken-ichi Mukaisho, Hiroyuki Sugihara
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      The 4th JCA-AACR Special Joint Conference
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      東京ベイ舞浜ホテル クラブリゾート, 浦安市
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      2013 Research-status Report
  • [Presentation] Lineage analysis of early and advanced tubular adenocarcinoma of the stomach based on array CGH and TP53 mutation analysis.

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      Takahisa Nakayama, Hiroto Yamamoto, Vo TN Diem, Den-ichi Mukaisho, Takanori Hattori, Hiroyuki Sugihara
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      The 4th JCA-AACR Special Joint Conference
    • Place of Presentation
      東京ベイ舞浜ホテル クラブリゾート, 浦安市
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  • [Presentation] 胃分化型腺癌のarray CGHによる解析:遺伝子コピー数変化からみたDormant clusterの特異性

    • Author(s)
      仲山 貴永、Vo TN Diem、向所 賢一、服部 隆則、杉原 洋行
    • Organizer
      第86回日本胃癌学会総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜市
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      2013 Research-status Report
  • [Presentation] DNAマイクロアレイデータのクラスタリングによる系譜解析:胃粘膜内癌の組織型別伸展リスクについて

    • Author(s)
      園田 文乃、向所 賢一、Vo TN Diem、仲山 貴永、藤山 佳秀、杉原 洋行
    • Organizer
      第86回日本胃癌学会総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜市
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  • [Presentation] Lineage analysis by aCGH data and mucin phenotypic expression in non-invasive gastric neoplasms.

    • Author(s)
      Diem Thi-Ngoc Vo, Takahisa Nakayama, Ken-ichi Mukaisho, Takanori Hattori, Hiroyuki Sugihara
    • Organizer
      第86回日本胃癌学会総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜市
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  • [Book] 腫瘍病理鑑別診断アトラス 胃癌(第2版)(担当:印環細胞癌)2015

    • Author(s)
      杉原 洋行
    • Publisher
      文光堂
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      2015 Annual Research Report
  • [Book] 組織細胞化学 2014 (担当:ゲノムレベルと発現レベルの系譜解析―早期癌の進展リスク予測を例として―)2014

    • Author(s)
      杉原 洋行
    • Publisher
      日本組織細胞化学会
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Remarks] 滋賀医科大学病理学講座分子診断病理学部門ホームページ

    • URL

      http://hqpatho1.luna.weblife.me/wlwp1/?cat=30

    • Related Report
      2015 Annual Research Report

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Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

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