• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Research on rapid identification method of pathogenic virus based on exhaustive gene amplification

Research Project

Project/Area Number 25460882
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Legal medicine
Research InstitutionNational Research Institute of Police Science

Principal Investigator

Muto Junji  科学警察研究所, 法科学第一部, 主任研究官 (80432186)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 酒井 洋樹  岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授 (40283288)
佐々 悠木子  東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (20582464)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2015: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywordsウイルス / 網羅的遺伝子検出法 / PCR / 死後経過 / 同定 / 定量PCR / 病理検査 / 法医学 / 死後変化 / 遺伝子 / 網羅的検出法 / シークエンス / 微生物
Outline of Final Research Achievements

We explored detectability of infecting viral genes from forensic sample including swab and organ by applying rapid determination system of viral RNA/DNA sequences (RDV). We detected genes of feline calicivirus and feline herpesvirus from throat and nasal cavity swab samples of autopsied cat by the RDV method, and then we rapidly identified these viruses by PCR and direct sequence of PCR product. To measure the impact of postmortem change on viral genes contained in organ, we performed quantitative PCRs that amplify a variety of lengths of influenza virus gene. As the result, it suggested the possibility that influenza virus genes were broken in the lung sample of the infected mouse. Therefore, it was deemed desirable to use a comparatively short fragment amplified by the RDV method in the case of detection of virus gene from organ sample.

Report

(5 results)
  • 2016 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2015 Research-status Report
  • 2014 Research-status Report
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (21 results)

All 2016 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (15 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Evaluation of the Universal Viral Transport system for long-term storage of virus specimens for microbial forensics.2015

    • Author(s)
      J. Hosokawa-Muto, Y. Fujinami, N. Mizuno
    • Journal Title

      J. Forensic Leg. Med.

      Volume: 34 Pages: 29-33

    • DOI

      10.1016/j.jflm.2015.04.019

    • Related Report
      2015 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of tools for environmental sampling of Bacillus anthracis spores.2015

    • Author(s)
      Y. Fujinami, J. Hosokawa-Muto, N. Mizuno
    • Journal Title

      Forensic Sci. Int.

      Volume: 257 Pages: 376-378

    • DOI

      10.1016/j.forsciint.2015.10.003

    • Related Report
      2015 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Parrot Bornavirus-2 and -4 RNA detected in wild birds samples in Japan are phylogenetically adjacent to those found in pet birds in Japan.2015

    • Author(s)
      Y. Sassa, VN. Bui, K. Saitoh, Y. Watanabe, S. Koyama, D. Endoh, M. Horie, K. Tomonaga, T. Furuya, M. Nagai, T. Omatsu, K. Imai, H. Ogawa, T. Mizutani
    • Journal Title

      Virus Genes

      Volume: 51 Issue: 2 Pages: 234-243

    • DOI

      10.1007/s11262-015-1240-7

    • Related Report
      2015 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assessment of viable bacteria and bacterial DNA in blood and bloodstain specimens stored under various conditions.2013

    • Author(s)
      J. Hosokawa-Muto, Y. Fujinami, N. Mizuno
    • Journal Title

      J. Forensic Leg. Med.

      Volume: 20 Issue: 8 Pages: 1035-1040

    • DOI

      10.1016/j.jflm.2013.09.024

    • Related Report
      2013 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular epidemiology of avian bornavirus from pet birds in Japan.2013

    • Author(s)
      Sassa Y, Horie M, Fujino K, Nishiura N, Okazaki S, Furuya T, Nagai M, Omatsu T, Kojima A, Mizugami M, Ueda K, Iki H, Ebisawa K, Tomonaga K, Mizutani T.
    • Journal Title

      Virus Genes

      Volume: 47 Issue: 1 Pages: 173-177

    • DOI

      10.1007/s11262-013-0913-3

    • Related Report
      2013 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] MALDI-TOF MSによる迅速スクリーニングのための微生物および生育培養液を対象とした迅速検出2016

    • Author(s)
      藤浪良仁、武藤淳二、水野なつ子
    • Organizer
      第89回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      大阪国際交流センター(大阪市)
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] MuBV-1の株化培養細胞での宿主域の検討2016

    • Author(s)
      佐々悠木子、村上智亮、鈴木和彦、朝長啓造、堀江真行
    • Organizer
      第9回日本ボルナウイルス研究会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学(鹿児島市)
    • Year and Date
      2016-01-29
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 次世代シーケンスデータからの病原因子遺伝子検知について2015

    • Author(s)
      水野なつ子、武藤淳二、藤浪良仁
    • Organizer
      日本法科学技術学会 第21回学術集会
    • Place of Presentation
      東京大学フューチャーセンター(柏市)
    • Year and Date
      2015-11-12
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] MALDI-TOF MSを用いた細菌迅速スクリーニングのためのデータベース作成について2015

    • Author(s)
      藤浪良仁、武藤淳二、水野なつ子
    • Organizer
      日本法科学技術学会 第21回学術集会
    • Place of Presentation
      東京大学フューチャーセンター(柏市)
    • Year and Date
      2015-11-12
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] ビーズ破砕法を用いたMALDI-TOF MSによる炭疽菌芽胞の迅速検出2015

    • Author(s)
      藤浪良仁,武藤淳二
    • Organizer
      第88回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      長良川国際会議場(岐阜市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-27
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] ジュウシマツに見つかったトリボルナウイルス(MuBV-1)の免疫組織学的解析と分離2015

    • Author(s)
      佐々悠木子,堀江真行,鈴木研太,加藤真樹,香川紘子,鈴木和彦,渋谷淳, Chanathip Thammakarn,竹原一明,古谷哲也,本田知之,朝長啓造,岡ノ谷一夫,水谷哲也
    • Organizer
      第8回日本ボルナウイルス研究会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)
    • Year and Date
      2015-03-24
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 次世代シーケンサーを用いた細菌の異同識別に関する基礎的検討2014

    • Author(s)
      水野なつ子,武藤淳二,藤浪良仁
    • Organizer
      日本法科学技術学会 第20回学術集会
    • Place of Presentation
      ホテルフロラシオン青山(東京都港区)
    • Year and Date
      2014-11-14
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] MALDI-TOF MS解析による細菌迅速スクリーニングの試料調整に関する検討2014

    • Author(s)
      藤浪良仁,武藤淳二,水野なつ子
    • Organizer
      日本法科学技術学会 第20回学術集会
    • Place of Presentation
      ホテルフロラシオン青山(東京都港区)
    • Year and Date
      2014-11-14
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 新規遺伝子型トリボルナウイルス(ABV-BF)の解析2014

    • Author(s)
      佐々悠木子,堀江真行,鈴木研太,加藤真樹,香川紘子,鈴木和彦,渋谷淳,Chanathip Thammakarn,竹原一明,古谷哲也,本田知之,朝長啓造,岡ノ谷一夫,水谷哲也
    • Organizer
      第157回日本獣医学会学術集会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-09
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Immunohistochemical detection of urokinase plasminogen activator and its receptor in canine hemangiosarcoma and cutaneous hemangioma2014

    • Author(s)
      Shehata Anwar,酒井洋樹,柳井徳磨
    • Organizer
      第157回日本獣医学会学術集会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-09
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 網羅的遺伝子増幅による動物死体材料からのウイルス遺伝子の検出2014

    • Author(s)
      武藤淳二,藤浪良仁,水野なつ子
    • Organizer
      第98次日本法医学会学術全国集会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2014-06-19
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] ウイルス検体採取キットに長期間保存したウイルスの生存状態及び遺伝子学的検査の評価

    • Author(s)
      武藤淳二, 藤浪良仁, 水野なつ子
    • Organizer
      第156回日本獣医学会学術集会
    • Place of Presentation
      岐阜大学(岐阜市)
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] Hepato-pathogenicity of Equine herpesvirus-9 (EHV-9) in hamsters

    • Author(s)
      El-Shaymaa El-Nahass, Noura Alkhalefa, Khaled El-Dakhly, 福士 秀人, 酒井 洋樹, 柳井 徳磨
    • Organizer
      第156回日本獣医学会学術集会
    • Place of Presentation
      岐阜大学(岐阜市)
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] 北海道の野鳥におけるボルナウイルスの浸潤状況

    • Author(s)
      佐々悠木子, Vuong Bui Nghia, 大場真己, 古谷哲也, 長井誠, 大松勉, 今井邦俊, 小川晴子, 水谷哲也
    • Organizer
      第156回日本獣医学会学術集会
    • Place of Presentation
      岐阜大学(岐阜市)
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] スワブによる細菌芽胞サンプリングに使用する抽出液の検討

    • Author(s)
      藤浪良仁, 武藤淳二, 水野なつ子
    • Organizer
      日本法科学技術学会第19回学術集会
    • Place of Presentation
      ホテルフロラシオン青山(東京都港区)
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Book] 小動物における細胞診の初歩の初歩 増補改訂版2016

    • Author(s)
      酒井洋樹
    • Total Pages
      295
    • Publisher
      チクサン出版
    • Related Report
      2016 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi