Development of diagnostic methods for all genotypes of norovirus.

• Project/Area Number: 25461528
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Infectious disease medicine
• Research Institution: National Institute of Infectious Diseases
• Principal Investigator: Shirato Haruko 国立感染症研究所, その他部局等, 研究員 (60356243)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2016-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2015)
• Budget Amount: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000); Fiscal Year 2015: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2014: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2013: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
• Keywords: ノロウイルス / 血液型抗原 / 診断 / 検出

Outline of Final Research Achievements

I attempted to establish two analytical methods to evaluate the carbohydrate-norovirus (NoV) interaction: surface plasmon resonance by using the virus-like particles (VLPs) of 25 strains from 18 genotypes and assays using red blood cells or cells modified on the glycosyltransferase gene. Then, using these analytical systems, I aimed at identifying the carbohydrate epitopes important in recognition by NoV and the carbohydrate-binding site on the virus. In addition, I analyzed the amino acid sequences of 15 genotypes, except the 18 genotypes used for this analysis, and narrowed down the candidate sequence of the carbohydrate-binding domain common to all 33 genotypes.

Research Products

• [Journal Article] Whole genomic analysis of human G12P[6] and G12P[8] rotavirus strains that have emerged in Kenya: Identification of porcine-like NSP4 genes. (2014)
  • Author(s): Komoto S, Wandera Apondi E, Shah M, Odoyo E, Nyangao J, Tomita M, Wakuda M, Maeno Y, Shirato H, Tsuji T, Ichinose Y, Taniguchi K.
  • Journal Title: Infect Genet Evol Volume: 27 Pages: 277-293
  • DOI: 10.1016/j.meegid.2014.08.002
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Isolation of cross-reactive human monoclonal antibodies that prevent binding of human noroviruses to histo-blood group antigen. (2014)
  • Author(s): K. HIGO-MORIGUCHI, H. Shirato, Y. Someya, Y. Kurosawa, N. Takeda, and K. Taniguchi
  • Journal Title: Journal od Medical Virology Volume: 86 Issue: 4 Pages: 558-567
  • DOI: 10.1002/jmv.23734
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 結晶構造を基にしたノロウイルスキャプシドタンパク質とルイス抗原との結合エネルギー解析 (2014)
  • Author(s): 久保田智巳、石田豊和、白土東子
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] ノロウイルスキャプシドタンパク質とルイス抗原との糖鎖認識機構 (2014)
  • Author(s): 石田豊和、久保田智巳、白土東子
  • Organizer: 第8回分子科学討論会
  • Place of Presentation: 広島大学東広島キャンパス
  • Year and Date: 2014-09-21 – 2014-09-24
• [Presentation] 結晶構造解析とQM/MM計算の組み合わせによるノロウイルスのルイス抗原結合解析 (2013)
  • Author(s): 久保田智巳、熊谷安希子、伊藤浩美、古川早苗、染谷雄一、石井孝司、脇田隆字、武田直和、成松久、白土東子
  • Organizer: 第32回日本糖質学会年会
  • Place of Presentation: 大阪国際交流センター
• [Presentation] ヒト型抗ノロウイルス抗体によるノロウイルス粒子-血液型抗原相互作用の阻害 (2013)
  • Author(s): 染谷雄一、守口匡子、白土東子、奥野良信、黒澤良和、武田直和、谷口孝喜
  • Organizer: 第86回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
• [Presentation] 結晶構造解析とQM/MM計算の組み合わせによるノロウイルスとルイス抗原の結合解析 (2013)
  • Author(s): 白土東子、石田豊和、熊谷安希子、伊藤浩美、古川早苗、染谷雄一、石井孝司、脇田隆字、成松久、久保田智巳
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場
• [Book] 最新医学、第70巻11月増刊号、「ノロウイルスと血液型抗原」 (2015)
  • Author(s): 白土東子
  • Total Pages: 9
  • Publisher: 最新医学社
• [Book] 宮城県獣医師会会報（「ウサギカリシウイルス、ヒトカリシウイルスの宿主特異性と血液型抗原」 (2015)
  • Author(s): 白土東子
  • Total Pages: 57
  • Publisher: 公益社団法人 宮城県獣医師会