• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

"Maizo"-Data Chemistry: Molecular Discovery from Chemical Big Data

Research Project

Project/Area Number 25540017
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Statistical science
Research Institution大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイエンス統合データベースセンター) (2015)
National Institute of Informatics (2013-2014)

Principal Investigator

Satoh Hiroko  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイ, 新領域融合研究センター, 准教授 (50291068)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) Uno Takeaki  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構国立情報学研究所, 情報学プリンシプル研究系, 教授 (00302977)
Arai Noriko  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構国立情報学研究所, 情報社会相関研究系, 教授 (40264931)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords埋蔵分子 / 化学反応経路探索 / 量子化学計算 / データケミストリ / ケモインフォマティクス / データマイニング / 可視化 / グラフィカルユーザインタフェース
Outline of Final Research Achievements

The “Maizo”-Data Chemistry project is aimed towards molecular and reaction discovery based on big data of quantum mechanical (QM) global reaction route mappings. We have developed a primary system for automatic calculations and accumulation of global reaction route maps (r-maps) based on the GRRM (Global Reaction Route Mapping) method. We also have developed a system, RMapViewer, for interactively analyzing r-maps. The RMapViewer software is free to download together with part of the accumulated r-map data. We have demonstrated that using RMapViewer makes it possible to effectively derive valuable information from r-maps by applying this system to QM-based automatic conformational analysis of saccharides. Furthermore, we have theoretically predicted the existence of a new carbon family.

Report

(4 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Research-status Report
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2016 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A Prism Carbon Molecule C202015

    • Author(s)
      Ohno, K.; Satoh, H.; Iwamoto, T.
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 44 Issue: 5 Pages: 712-714

    • DOI

      10.1246/cl.150120

    • NAID

      130005067983

    • Related Report
      2015 Annual Research Report 2014 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Prism-C2n carbon dimer, trimer, and nano-sheets: A quantum chemical study2015

    • Author(s)
      Ohno, K.; Satoh, H.; Iwamoto, T.
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 633 Pages: 120-125

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.05.024

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] "Maizo"-chemistry Project: toward Molecular- and Reaction Discovery from Quantum Mechanical Global Reaction Route Mappings2015

    • Author(s)
      Satoh, H.; Oda, T.; Nakakoji, K.; Uno, T.; Iwata, S.; Ohno, K.
    • Journal Title

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      Volume: 14 Issue: 3 Pages: 77-79

    • DOI

      10.2477/jccj.2015-0048

    • NAID

      130005099926

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Wavy Carbon: A New Series of Carbon Structures Explored by Quantum Chemical Calculations2015

    • Author(s)
      Ohno, K.; Satoh, H.; Iwamoto, T.; Tokoyama, H.; Yamakado, H.
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 639 Pages: 178-182

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.09.026

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 新型炭素構造の探索2016

    • Author(s)
      大野公一, 佐藤寛子, 岩本武明, 時子山宏明, 山門英雄
    • Organizer
      第96回日本化学会春季年会
    • Place of Presentation
      京都(同志社大学・京田辺)
    • Year and Date
      2016-03-24
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 新炭素単体Prism Carbonの構造とエネルギー2015

    • Author(s)
      大野公一, 佐藤寛子, 岩本武明, 時子山宏明, 山門英雄
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京(東京工業大学)
    • Year and Date
      2015-09-16
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 多角柱型炭素構造の反応経路と安定性2015

    • Author(s)
      大野公一, 佐藤寛子, 岩本武明, 時子山宏明, 山門英雄
    • Organizer
      化学反応経路探索のニューフロンティア2015
    • Place of Presentation
      東京(品川区立総合区民会館)
    • Year and Date
      2015-09-15
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] QM-based Data Chemistry: A Strategy for Computational Molecular/Reaction Analysis Based on The Global Reaction Route Mapping2015

    • Author(s)
      Satoh, H.; Oda, T.; Nakakoji, K.; Uno, T.; Tanaka, H.; Iwata, S.; Ohno, K.
    • Organizer
      PSI-K 2015 Conference
    • Place of Presentation
      San Sebastian (Kursaal Congress Centre), Spain
    • Year and Date
      2015-09-06
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 「埋蔵分子」発掘プロジェクト:量子化学に基づくグローバル反応マップデータからの発見2015

    • Author(s)
      佐藤寛子, 小田朋宏, 中小路久美代, 宇野毅明, 岩田覚, 大野公一
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会2015春季年会
    • Place of Presentation
      東京(東京工業大学)
    • Year and Date
      2015-05-28
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 大域的ポテンシャル表面の量子化学自動探索に基づく埋蔵分子の発掘2015

    • Author(s)
      大野公一, 佐藤寛子, 岩本武明
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会2015春季年会
    • Place of Presentation
      東京(東京工業大学)
    • Year and Date
      2015-05-28
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] データケミストリ:理論化学データを基盤とするインフォマティクスによる新規物質・反応経路の発見2015

    • Author(s)
      佐藤寛子, 小田朋宏, 中小路久美代, 宇野毅明, 岩田覚, 大野公一
    • Organizer
      第18回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      大阪(大阪大学・豊中)
    • Year and Date
      2015-05-20
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 炭素の新単体(Prism-C2n)の2次元周期構造の探索2015

    • Author(s)
      大野公一, 佐藤寛子, 岩本武明
    • Organizer
      第18回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      大阪(大阪大学・豊中)
    • Year and Date
      2015-05-20
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] GRRM法による超原子価化合物候補の自動探索2015

    • Author(s)
      大野公一, 佐藤寛子, 岩本武明
    • Organizer
      第95回日本化学会春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学, 千葉
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] GRRM法による未知化学の探索:H4C42015

    • Author(s)
      大野公一, 佐藤寛子, 岩本武明
    • Organizer
      第12回京都大学福井謙一記念研究センターシンポジウム-諸熊奎治先生傘寿記念-
    • Place of Presentation
      福井謙一記念研究センター, 京都
    • Year and Date
      2015-01-23
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] 未知の埋蔵分子発掘プロジェクト2014

    • Author(s)
      佐藤寛子
    • Organizer
      講演会「GRRMで拓く化学のニューフロンティア」
    • Place of Presentation
      ダイヤ八重洲口ビル, 東京
    • Year and Date
      2014-11-30
    • Related Report
      2014 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Chemoinformatics Meets Quantum Chemistry: A Strategy for Computational Molecular/Reaction Analysis Based on The Global Reaction Route Maps.2014

    • Author(s)
      Satoh, H.; Oda, T.; Nakakoji, K.; Uno, T.; Tanaka, H.; Iwata, S.; Luethi, H.P.; Ohno, K.
    • Organizer
      2014 Fall Meeting of the Swiss Chemical Society
    • Place of Presentation
      チューリッヒ(スイス)
    • Year and Date
      2014-09-11
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] GRRMによる埋蔵分子発掘プロジェクトと化学反応経路マップの可視化2014

    • Author(s)
      佐藤寛子, 小田朋宏
    • Organizer
      GRRMチュートリアル2014
    • Place of Presentation
      ダイヤ八重洲口ビル, 東京
    • Year and Date
      2014-06-24
    • Related Report
      2014 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 「埋蔵分子」発掘プロジェクト:化学反応経路マップのインタラクティブ可視化に向けて2014

    • Author(s)
      佐藤寛子, 小田朋宏,中小路久美代,宇野毅明, 田中宏明, 岩田覚, 大野公一
    • Organizer
      インタラクション2014
    • Place of Presentation
      日本科学未来館(東京)
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] QM-Based Data Chemistry: Chemoinformatics Meets Quantum Chemistry2014

    • Author(s)
      Hiroko Satoh
    • Organizer
      Asian International Symposium, 94th Annual Meeting of The Chemical Society of Japan (2014)
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋)
    • Related Report
      2013 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 理論化学―データケミストリー:超球面探索法より得られる化学反応経路データの蓄積と活用2013

    • Author(s)
      佐藤寛子,Stefano Borini,小田朋宏,中小路久美代,大野公一
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] 化学反応経路の全面探索の可視化とデータマイニングによる発見への取組み2013

    • Author(s)
      佐藤寛子,小田朋宏,中小路久美代,大野公一
    • Organizer
      化学反応経路探索のニューフロンティア2013
    • Place of Presentation
      京都大学福井謙一記念研究センター(京都)
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Remarks] 未探索の新物質をデスクトップで発掘しよう

    • URL

      http://rc.rois.ac.jp/article/database/201409_1.html

    • Related Report
      2015 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi