Exploration of Systems Biology of Molecular Individuality
| Project/Area Number |
25650044
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Research Field |
Biophysics
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
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| Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) |
LI Chun-Biu 北海道大学, 電子科学研究所, 准教授 (90397795)
KAWAI Shinnosuke 北海道大学, 電子科学研究所, 特任助教 (90624065)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2015)
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| Budget Amount *help |
¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
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| Keywords | 分子個性 / 情報理論 / F1-ATPase / ネットワーク / 1分子計測 / 変化点解析 / 反応ネットワーク / 経路の多重性 / ノイズ除去 / 遷移状態 / 自由エネルギー地形 / 一分子計測 / 非平衡定常状態反応ネットワーク / システム生物学 |
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| Outline of Final Research Achievements |
From single molecule finite time series that changes discretely such as opened or closed, (substrate) bound or unbound, we developed a novel analysis method that objectively elucidates the state of molecules in terms of network representation and enables us to predict the future output of the molecular data in time. In addition, by developing a novel data analysis method that does not assume a form of function of likelihood, we revealed the molecular mechanism of efficient energy conversion in F1-ATPase that synthesizes “energy money”inside cell, ATP, and ATP hydrolysis designs the order of reactions.
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Report
(4 results)
Research Products
(96 results)
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[Presentation] マルコフ連鎖の時間階層的クラスタリング2015
Author(s)
永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 武次 徹也, 小松崎 民樹
Organizer
ERATO湊離散構造処理系プロジェクト 「2015年度 秋のワークショップ」
Place of Presentation
丸駒温泉(北海道千歳市)
Year and Date
2015-11-08
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[Presentation] 複雑反応ネットワークに埋め込まれた時間階層構造の解読2015
Author(s)
Yutaka Nagahata, Satoshi Maeda, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Takashi Horiyama, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki
Organizer
第53回日本生物物理学会
Place of Presentation
金沢大学角間キャンパス自然科学本館(石川県金沢市)
Year and Date
2015-09-13
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[Presentation] 植物の中の局所微小管と細胞成長の関係について2015
Author(s)
Satoru Tsugawa, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Organizer
第53回日本生物物理学会
Place of Presentation
金沢大学角間キャンパス自然科学本館(石川県金沢市)
Year and Date
2015-09-13
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[Presentation] マルコフ連鎖の時間階層的クラスタリング2015
Author(s)
永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 武次 徹也, 小松崎 民樹
Organizer
ERATO湊離散構造処理系プロジェクト 「2015年度 初夏のワークショップ」
Place of Presentation
北海道大学情報科学研究科 ERATO 会議室(北海道札幌市)
Year and Date
2015-06-11
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[Presentation] 分子個性と少数性2014
Author(s)
小松崎 民樹
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第52回日本生物物理学会年会
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札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
Year and Date
2014-09-26
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