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Construction of a guide-RNA for site-directed RNA mutagenesis utilizing intracellular A-to-I RNA editing

Research Project

Project/Area Number 25750390
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Biomolecular chemistry
Research InstitutionFukuoka University

Principal Investigator

FUKUDA MASATORA  福岡大学, 理学部, 助教 (90526691)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
KeywordsRNA編集 / ガイドRNA / RNA変異導入 / in vitroセレクション / 分子設計 / 機能性RNA / ADAR / 部位特異的変異導入
Outline of Final Research Achievements

Genetic engineering technologies for regulating intracellular target-gene function and/or expression have been widely used for basic research of vital biological phenomena. RNA mutagenesis has the potential to become a powerful gene-regulation methodology as an alternative to DNA mutagenesis. Adenosine-to-inosine (A-to-I) RNA editing that alters genetic information at the transcript level is an important biological process widely conserved in metazoans. Therefore, a versatile RNA mutagenesis method can be developed by taking advantage of intracellular the RNA editing mechanism. Here, we developed a novel guide RNA that is capable of inducing A-to-I mutations by guiding the editing enzyme, human adenosine deaminase acting on RNA.

Report

(4 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Research-status Report
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2015 2014 2013

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (22 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Identification of an RNA element for specific coordination of A-to-I RNA editing on HTR2C pre-mRNA.2015

    • Author(s)
      Fukuda M, Oyama Y, Nishitarumizu A, Omura M, Nose K, Deshimaru M.
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 20 Issue: 10 Pages: 834-846

    • DOI

      10.1111/gtc.12272

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] One-pot synthesis of dibenzo[b,h][1,6]naphthyridines from 2-acetylaminobenzaldehyde: application to a fluorescent DNA-binding compound2014

    • Author(s)
      Kentaro Okuma *, Tomohiro Koga , Saori Ozaki , Yutaro Suzuki , Kenta Horigami , Noriyoshi Nagahora , Kosei Shioji , Masatora Fukuda and Masanobu Deshimaru
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 50 Issue: 98 Pages: 15525-15528

    • DOI

      10.1039/c4cc07807a

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Improved design of hammerhead ribozyme for selective digestion of target RNA through recognition of site-specific adenosine-to-inosine RNA editing.2014

    • Author(s)
      Fukuda M, Kurihara K, Yamaguchi S, Oyama Y, Deshimaru M.
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 20 Issue: 3 Pages: 392-405

    • DOI

      10.1261/rna.041202.113

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    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Evaluating a molecular mechanism of the intracellular A-to-I RNA editing by analyzing a reaction behavior of ADARs in vitro and in the cell2015

    • Author(s)
      野瀬 可那子、西垂水 梓、梅野 紘充、中川 裕之、弟子丸 正伸、福田 将虎
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      ホノルル、ハワイ(Hawaii Convention Center)
    • Year and Date
      2015-12-15
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  • [Presentation] Construction of artificial guide-RNAs for a site-directed RNA mutagenesis utilizing intracellular RNA editing by hADAR22015

    • Author(s)
      梅野 紘充、野瀬 可那子、西垂水 梓、福田 将虎
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      ホノルル、ハワイ(Hawaii Convention Center)
    • Year and Date
      2015-12-15
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  • [Presentation] HTR2C pre-mRNAの編集における編集酵素ADAR2のdsRBDの役割2015

    • Author(s)
      西垂水 梓、小山 唯、弟子丸 正伸、福田 将虎
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会合同大会(BMB2015)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2015-12-01
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    • Author(s)
      福田 将虎
    • Organizer
      平成27年度化学系学協会東北大会
    • Place of Presentation
      弘前大学文京キャンパス
    • Year and Date
      2015-09-12
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    • Invited
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    • Author(s)
      梅野 紘充、西垂水 梓、野瀬 可那子、福田 将虎
    • Organizer
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      熊本大学工学部・黒髪南キャンパス
    • Year and Date
      2015-09-10
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      野瀬 可那子、西垂水 梓、中川 裕之、弟子丸 正伸、福田 将虎
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      第17回RNA学会年会
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      ホテルライフォート札幌
    • Year and Date
      2015-07-15
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      梅野 紘充、西垂水 梓、弟子丸 正伸、福田 将虎
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      第17回RNA学会年会
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      ホテルライフォート札幌
    • Year and Date
      2015-07-15
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      西垂水 梓、小山 唯、弟子丸 正伸、福田 将虎
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      第17回RNA学会年会
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      ホテルライフォート札幌
    • Year and Date
      2015-07-15
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      野瀬 可那子、中川 裕之、弟子丸 正伸、福田 将虎
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      第37回 分子生物学会年会
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      パシフィコ横浜
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      2014-11-25 – 2014-11-27
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      尾村 美樹、弟子丸 正伸、佐藤 慎一、福田 将虎
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      第37回 分子生物学会年会
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      パシフィコ横浜
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      2014-11-25 – 2014-11-27
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      野瀬 可那子、中川 裕之、弟子丸 正伸、福田 将虎
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      第87回 日本生化学会大会
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      国立京都国際会館
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      尾村 美樹、弟子丸 正伸、佐藤 慎一、福田 将虎
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      第87回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-18
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  • [Presentation] 基質RNA発現量に依存しない細胞内A-to-I RNA編集機構2014

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      野瀬 可那子、中川 裕之、弟子丸 正伸、福田 将虎
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      第16回 RNA学会年会
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      ウインクあいち
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  • [Presentation] 細胞を基盤としたスクリーニングによるA-to-I RNA編集阻害剤の構築2014

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      尾村 美樹、弟子丸 正伸、佐藤 慎一、福田 将虎
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      第16回 RNA学会年会
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      ウインクあいち
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      2014-07-23 – 2014-07-25
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      尾村 美樹、弟子丸 正伸、福田 将虎
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 部位特異的RNA変異導入方法およびそれに使用する標的編集ガイドRNAならびに標的RNA-標的編集ガイドRNA複合体2015

    • Inventor(s)
      福田将虎
    • Industrial Property Rights Holder
      福田将虎
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2015-140894
    • Filing Date
      2015-07-14
    • Related Report
      2015 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

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