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エンハンサーによるlncRNAを介した新しい遺伝子発現制御機構の解析

Research Project

Project/Area Number 25840005
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Molecular biology
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

小野口 真広  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 (30645297)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2014-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2013: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywordslong noncoding RNA / エンハンサー / ニューロン分化
Research Abstract

本年度の実験計画に基づき、まず、utNgn1が標的遺伝子であるNeurog1のプロモーター領域のヒストン修飾に影響を与えるかを、クロマチン免疫沈降法(ChIP)により検討した。大脳新皮質由来の神経系前駆細胞を用いてutNgn1をノックダウンし、転写活性化状態に関連するヒストン修飾および転写抑制に関連するヒストン修飾抗体を用いてChIPを行った。その結果、Neurog1プロモーターにおいては、これらのヒストン修飾レベルに大きな変化は見られなかった。そこで次に、utNgn1がRNA ポリメラーゼIIのリクルートあるいは転写開始や転写伸長などに関与している可能性を RNAポリメラーゼII抗体を用いてChIPにより検討した。その結果興味深いことに、 utNgn1がNeurog1の転写の開始や伸長に関与している可能性を示唆する結果が得られた。さらにutNgn1のエンハンサーとしての機能を検討するために、エンハンサーとプロモーター領域の近接具合をChromosome Conformation Capture(3C)法により評価した。その結果、神経系前駆細胞がニューロン分化する過程で、Neurog1遺伝子座のエンハンサー−プロモーター間が近接する可能性が示唆された。さらにこの近接とutNgn1の関係を検討した。これらの結果から、utNgn1がどのようにNeurog1の転写促進に関与しているのかについて、非常に示唆的な結果が得られた。 本結果に基づきさらに詳細に解析を進めることで、lncRNAの新しい作用機序が明らかになることが期待される。

Report

(1 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2014 2013

All Presentation (3 results)

  • [Presentation] Regulation of neuronal differentiation by Polycomb components Cbx2 and Cbx72014

    • Author(s)
      Taruho Endoh, Masafumi Tsuboi, Masahiro Onoguchi, Yusuke Hirabayashi and Yukiko Gotoh
    • Organizer
      第7回神経発生討論会
    • Place of Presentation
      大阪大学吹田キャンパス
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] A long noncoding RNA derived from an enhancer region regulates Neurogenin1 gene expression2013

    • Author(s)
      Masahiro Onoguchi and Yukiko Gotoh
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting
    • Place of Presentation
      NY, USA
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulation of neuronal differentiation by Polycomb components Cbx2 and Cbx72013

    • Author(s)
      Taruho Endoh, Masafumi Tsuboi, Masahiro Onoguchi, Yusuke Hirabayashi and Yukiko Gotoh
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

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