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Analysis of higher-order chromatin structure of the C/EBPalpha gene locus in adipocytes by 3C (Chromosome Conformation Capture) technique

Research Project

Project/Area Number 25860742
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Metabolomics
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

AOYAMA TOMOHISA  東京大学, 医学部附属病院, 研究員 (50645538)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2013: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords遺伝子 / 転写制御 / 高次クロマチン構造 / 3C / 脂肪細胞 / 分化 / 糖尿病 / 肥満 / 発生・分化 / 遺伝子発現制御
Outline of Final Research Achievements

Adipogenesis is controlled by a cascade of transcription factors. Although the positive feedback loop established by the master regulators PPARγ and C/EBPα is crucial, the precise mechanism by which PPARγ regulates Cebpa gene expression remains elusive. Here, we performed ChIP-seq using PPARγ antibodies and identified specific functional enhancers in the distal downstream region of the Cebpa gene in differentiated 3T3-L1 adipocytes. These regions exhibited increased histone H3 acetylation and chromatin accessibility (as judged by FAIRE-qPCR) during differentiation. 3C (Chromosome Conformation Capture) assays revealed physical interactions between these distal enhancers and the promoter of the Cebpa gene, which were enhanced upon differentiation. Our findings suggest that transactivation of C/EBPα expression by PPARγ involves distal enhancers, long-range DNA looping and hierarchical epigenetic changes.

Report

(3 results)
  • 2014 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2015 2014 Other

All Presentation (14 results)

  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析2015

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、冨岡 恵、岩部真人、岩部美紀、杉山拓也、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第29回日本糖尿病・肥満動物学会年次学術集会
    • Place of Presentation
      京都大学医学部芝蘭会館(京都)
    • Year and Date
      2015-02-13
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Long-Range Transactivation of C/EBPα Gene Expression by PPARγ through Distal Enhancers during Adipocyte Differentiation2014

    • Author(s)
      Tomohisa Aoyama, Hironori Waki, Toshimasa Yamauchi, Ken-ichi Wakabayashi, Tsuyoshi Inoue, Masahiro Nakamura, Jing Yu, Kazumi take, Wei Sun, Masato Iwabu, Miki Okada-Iwabu, Ueki Kojiro, Youichiro Wada, Shuichi Tsutsumi, Tatsuhiko Kodama, Juro Sakai, Hiroyuki Aburatani and Takashi Kadowaki
    • Organizer
      The 4D Nucleome 2014
    • Place of Presentation
      Hiroshima, Japan
    • Year and Date
      2014-12-18
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析2014

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、冨岡 恵、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第35回日本肥満学会
    • Place of Presentation
      フェニックスシーガイアリゾート コンベンションセンター(宮崎)
    • Year and Date
      2014-10-24
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析2014

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、冨岡 恵、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第29回日本糖尿病合併症学会
    • Place of Presentation
      都市センターホテル(東京)
    • Year and Date
      2014-10-03
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Long-Range Transactivation of C/EBPα Gene Expression by PPARγ through Distal Enhancers during Adipocyte Differentiation2014

    • Author(s)
      Tomohisa Aoyama, Hironori Waki, Toshimasa Yamauchi, Ken-ichi Wakabayashi, Tsuyoshi Inoue, Masahiro Nakamura, Jing Yu, Kazumi take, Wei Sun, Masato Iwabu, Miki Okada-Iwabu, Ueki Kojiro, Youichiro Wada, Shuichi Tsutsumi, Tatsuhiko Kodama, Juro Sakai, Hiroyuki Aburatani and Takashi Kadowaki
    • Organizer
      9th Metabolic Syndrome, Type 2 Diabetes and Atherosclerosis Congress
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2014-09-14
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      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析2014

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、冨岡 恵、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第18回アディポサイエンス・シンポジウム
    • Place of Presentation
      千里ライフサイエンスセンター(大阪)
    • Year and Date
      2014-08-23
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析2014

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、冨岡恵、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第32回内分泌代謝学サマーセミナー
    • Place of Presentation
      富士レークホテル(山梨)
    • Year and Date
      2014-07-11
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Long-Range Transactivation of C/EBPα Gene Expression by PPARγ through Distal Enhancers during Adipocyte Differentiation2014

    • Author(s)
      Tomohisa Aoyama, Hironori Waki, Toshimasa Yamauchi, Ken-ichi Wakabayashi, Tsuyoshi Inoue, Masahiro Nakamura, Jing Yu, Kazumi take, Wei Sun, Masato Iwabu, Miki Okada-Iwabu, Ueki Kojiro, Youichiro Wada, Shuichi Tsutsumi, Tatsuhiko Kodama, Juro Sakai, Hiroyuki Aburatani and Takashi Kadowaki
    • Organizer
      74th Scientific Sessions of American Diabetes Association
    • Place of Presentation
      San Francisco, USA
    • Year and Date
      2014-06-13
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析2014

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、冨岡恵、孫威、平池勇雄、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第57回日本糖尿病学会年次学術集会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場(大阪)
    • Year and Date
      2014-05-24
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析2014

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、冨岡恵、孫威、平池勇雄、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第87回日本内分泌学会学術総会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡)
    • Year and Date
      2014-04-24
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、冨岡 恵、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第34回日本肥満学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第18回アディポサイエンス・シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪府豊中市
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第13回 東京大学生命科学シンポジウム BIO UT
    • Place of Presentation
      東京
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      2013 Research-status Report
  • [Presentation] 脂肪細胞における遠位エンハンサーを介したPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構の解析

    • Author(s)
      青山倫久、脇裕典、山内敏正、若林賢一、井上 剛、中村正裕、于静、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、植木浩二郎、和田 洋一郎、堤修一、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第56回日本糖尿病学会年次学術集会
    • Place of Presentation
      熊本県熊本市
    • Related Report
      2013 Research-status Report

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Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

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