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Studies on the functional molecular mechanisms of protein components at the ribosomal GTPase-associated center

Research Project

Project/Area Number 25870287
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Molecular biology
Applied biochemistry
Research InstitutionShinshu University

Principal Investigator

NOMURA Takaomi  信州大学, 学術研究院繊維学系, 助教 (90362110)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsリボソーム / GTPaseセンター / GTPase翻訳因子 / ストークタンパク質 / L11/eL12 / 生物界特異性 / L11 / ストーク / L7/L12 / P1-P2 / L10
Outline of Final Research Achievements

We proposed that the biological and functional significances for the multiple copies of ribosomal stalk protein lie in the efficient assembly of the stalk proteins into the ribosomal particles and the enhancement of the translation rate related to the interaction with GTPase translational factors. Furthermore, we revealed that the C-terminal domain of the stalk protein is a crucial structural element, although L11 (eL12) also acts in coordinated manner, for kingdom-dependent specificity of the ribosome-GTPase translational factor interaction.

Report

(4 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Research-status Report
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (33 results)

All 2016 2015 2014 2013

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (27 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Involvement of ribosomal protein L6 in assembly of functional 50S ribosomal subunit in Escherichia coli cells.2016

    • Author(s)
      Shigeno Y, Uchiumi T, Nomura T.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: in press Issue: 1 Pages: 237-242

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.03.085

    • NAID

      120007100576

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Molecular cloning, gene expression analysis, and recombinant protein expression of novel silk proteins from larvae of a retreat-maker caddisfly, Stenopsyche marmorata2015

    • Author(s)
      Xue Bai, Mayo Sakaguchi, Yuko Yamaguchi, Shiori Ishihara, Masuhiro Tsukada, Kimio Hirabayashi, Kousaku Ohkawa, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 464 Issue: 3 Pages: 814-819

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2015.07.041

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] トビケラ目昆虫類の大量飛来時期の高精度予測手法の開発2015

    • Author(s)
      平林 公男, 大川 浩作, 新井 亮一, 野村 隆臣, 塚田 益裕, 阿部 康次
    • Journal Title

      昆虫と自然

      Volume: 50 Pages: 42-45

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Chain Conformational Study on Underwater Silk Proteins from Caddisfly, Stenopsyche marmorata. -Implication of a Fiber-forming Mechanism–2013

    • Author(s)
      Ohkawa, K., Hachisu, M., Nomura, T., Arai, R., Hirabayashi, K., Tsukada, M., and Abe, K.
    • Journal Title

      Advanced Materials Res.

      Volume: 796 Pages: 3-8

    • DOI

      10.4028/www.scientific.net/amr.796.3

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Long-range periodic sequence of Stenopsyche marmorata cement/silk protein: Purification and biochemical characterization2013

    • Author(s)
      Kousaku Ohkawa, Yumi Miura, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai, Masuhiro Tsukada and Kimio Hirabayashi
    • Journal Title

      Biofouling

      Volume: 29 (4) Issue: 4 Pages: 357-367

    • DOI

      10.1080/08927014.2013.774376

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    • Author(s)
      土屋 正明, 三上 翼, 小西 繭, 森脇 洋, 野村 隆臣
    • Organizer
      BMB2015
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      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
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      金森 茉依, 大川 浩作, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 野村 隆臣
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
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      2015-12-01
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      Nomura, T., Arai, R., Ohkawa, K., Hirabayashi, K., and Tsukada, M.
    • Organizer
      International Workshop on Technology Foundation for Practical Bioadhesion Engineering
    • Place of Presentation
      Shinshu university (Nagano, Ueda)
    • Year and Date
      2015-11-26
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      Ohkawa, K., Nomura, T., Arai, R., Tsukada, M., and Hirabayashi, K.
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      International Symposium on Frontier Biotechnology 2015
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      Shinshu university (Nagano, Minamiminowa)
    • Year and Date
      2015-08-20
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      大川 浩作, 野村 隆臣, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕
    • Organizer
      第64回高分子学会年次大会
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      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2015-05-27
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    • Author(s)
      重野 雄太, 伊藤 美穂, 野村 隆臣
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      第37回日本生化学会中部支部例会
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      信州大学旭総合研究棟(長野県松本市)
    • Year and Date
      2015-05-23
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    • Author(s)
      伊藤 美穂, 古杉 隼人, 野村 隆臣
    • Organizer
      第37回日本生化学会中部支部例会
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      信州大学旭総合研究棟(長野県松本市)
    • Year and Date
      2015-05-23
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  • [Presentation] 新規アルギン酸資化細菌 Nubsella sp. NT5のアルギン酸能の評価とアルギン酸リアーゼの最適精製条件の検討2015

    • Author(s)
      土屋 正明, 三上 翼, 小西 繭, 森脇 洋, 野村 隆臣
    • Organizer
      第37回日本生化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      信州大学旭総合研究棟(長野県松本市)
    • Year and Date
      2015-05-23
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  • [Presentation] 新規アルギン酸資化細菌 Nubsella sp. NT5のアルギン酸資化関連遺伝子の推定とクローニング2015

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      三上 翼, 土屋 正明, 小西 繭, 森脇 洋, 野村 隆臣
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      第37回日本生化学会中部支部例会
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      信州大学旭総合研究棟(長野県松本市)
    • Year and Date
      2015-05-23
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  • [Presentation] 水生昆虫ヒゲナガカワトビケラ (Stenopsyche marmorata) のシルクを構成するタンパク質成分の同定2015

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      金森 茉依, 大川 浩作, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 野村 隆臣
    • Organizer
      第37回日本生化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      信州大学旭総合研究棟(長野県松本市)
    • Year and Date
      2015-05-23
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      志水 誠, 伊藤 吹夕, 小西 繭, 森脇 洋, 野村 隆臣
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
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  • [Presentation] ヒゲナガカワトビケラ由来新規シルク蛋白質及び関連蛋白質の同定、解析、発現系構築2014

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      坂口 真代, 白雪, 山口 裕子, 野村 隆臣, 大川 浩作, 石川 えり, 阿部 康次, 塚田 益弘, 平林 公男, 新井 亮一
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
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  • [Presentation] グリシンオキシダーゼの基質阻害様式に関する研究2014

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      塩野 貴子, 鈴村 菖, 西矢 芳昭, 新井 亮一, 野村 隆臣
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      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
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      2014-11-25 – 2014-11-27
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      重野 雄太, 古杉 隼人, 内海 利男, 野村 隆臣
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      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
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      Ohkawa, K., Nomura, T., Arai, R., Hirabayashi, K., Tsukada, M., and Abe, K.
    • Organizer
      International Symposium on Fiber Science and Technology 2014 (ISF2014)
    • Place of Presentation
      Tokyo Fashion Town (Koto-ku, Tokyo)
    • Year and Date
      2014-09-28 – 2014-10-01
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      大川 浩作, 八須 匡和, 野村 隆臣, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 阿部 康次
    • Organizer
      日本生物高分子学会 2014年度大会
    • Place of Presentation
      信州大学繊維学部 (長野県上田市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-13
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      塩野 貴子, 西矢 芳昭, 新井 亮一, 野村 隆臣
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      日本生物高分子学会 2014年度大会
    • Place of Presentation
      信州大学繊維学部 (長野県上田市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-13
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  • [Presentation] リボソーム工学を用いた新規タンパク質合成系の構築2014

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      古杉 隼人, 重野 雄太, 野村 隆臣
    • Organizer
      日本生物高分子学会 2014年度大会
    • Place of Presentation
      信州大学繊維学部 (長野県上田市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-13
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  • [Presentation] 大腸菌リボソームタンパク質L6の欠損が細胞機能に与える影響2014

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      重野 雄太, 古杉 隼人, 野村 隆臣
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      日本生物高分子学会 2014年度大会
    • Place of Presentation
      信州大学繊維学部 (長野県上田市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-13
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  • [Presentation] stalkタンパク質のCTDがリボソームの生物界特異的なGTPase翻訳伸長因子選択性を決定する2014

    • Author(s)
      五味 龍作, 遊佐 和之, 内海 利男, 野村 隆臣
    • Organizer
      第16回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      ウインクあいち (愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
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  • [Presentation] Geobacillus kaustophilus由来Glycine oxidaseのX線結晶構造解析2014

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      塩野 貴子, 新井 亮一, 西矢 芳昭, 野村 隆臣
    • Organizer
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ワークピア横浜 / 横浜産貿ホール マリネリア (神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-06-25 – 2014-06-27
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  • [Presentation] ヒゲナガカワトビケラ由来新規シルク蛋白質及び関連蛋白質の網羅的同定と解析2014

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      白 雪, 山口 裕子, 野村 隆臣, 大川 浩作, 石川 えり, 塚田 益裕, 阿部 康次, 平林 公男, 新井 亮一
    • Organizer
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ワークピア横浜 / 横浜産貿ホール マリネリア (神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-06-25 – 2014-06-27
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      大川 浩作, 八須 匡和, 野村 隆臣, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 阿部 康次
    • Organizer
      平成26年度繊維学会年次大会 (創立70周年記念大会)
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀 (東京都江戸川区)
    • Year and Date
      2014-06-11 – 2014-06-13
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  • [Presentation] キレート剤により可溶化されるヒゲナガカワトビケラ (Stenopsyche marmorata) 幼虫シルクタンパク質成分2014

    • Author(s)
      大川 浩作, 八須 匡和, 野村 隆臣, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 阿部 康次
    • Organizer
      第63回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場 (愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2014-05-28 – 2014-05-30
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  • [Presentation] Direct solubilization of phosphorylated proteins from larval adhesive net of caddisfly, Stenopsyche marmorata2014

    • Author(s)
      Ohkawa, K., Nomura, T., Arai, R., Hirabayashi, K., Tsukada, M., and Abe, K.
    • Organizer
      2nd International Conference on Biological and Biomimetic Adhesives (ICBBA2014)
    • Place of Presentation
      Marmara University (Sultanahmet-Istanbul, Turkey)
    • Year and Date
      2014-05-06 – 2014-05-09
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  • [Presentation] Byssus precursor proteins from asian freshwater mussel, Limnoperna fortunei2014

    • Author(s)
      Ohkawa, K., Hachisu, M., Nomura, T.
    • Organizer
      2nd International Conference on Biological and Biomimetic Adhesives (ICBBA2014)
    • Place of Presentation
      Marmara University (Sultanahmet-Istanbul, Turkey)
    • Year and Date
      2014-05-06 – 2014-05-09
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    • Author(s)
      小暮 剛士, 重野 雄太, 内海 利男, 野村 隆臣
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規ベクター及びこれを用いた可溶化タンパク質の製造方法2015

    • Inventor(s)
      野村隆臣
    • Industrial Property Rights Holder
      信州大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2015-226253
    • Filing Date
      2015-11-19
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URL: 

Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

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