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Development of informatics infrastructure for the comparison of various insect genomes

Research Project

Project/Area Number 25870379
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Insect science
Genome biology
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

Masaaki Kotera  東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 講師 (90643669)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2015: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2014: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2013: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords昆虫ゲノム / 昆虫 / ゲノム / データベース / 化学生態学 / 生物間相互作用 / 植物 / オミックス / 遺伝子 / 化合物 / 情報学的基盤 / 鱗翅目 / オーソログ / 次世代シークエンサー
Outline of Final Research Achievements

In this study we collected genomes and other genomic informations of insects, as well as novel sequencing of butterfly insects. As the known genome information, we collected various insect genomes and proteins in public that have been sequenced by many researchers worldwide. As the novel genome sequencing, we selected a number of swallowtail butterflies, captured them alive and extracted their DNA, subjected to the next generation sequencer, and assembled. We also collected various information of insects, including taxonomy, edible plants, attractant and repellents.

Report

(4 results)
  • 2015 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2014 Research-status Report
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2016 2015 2014 2013 Other

All Presentation (19 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] データ統合とオミックス解析による昆虫・植物間相互作用解析と昆虫代謝予測2016

    • Author(s)
      小寺正明、武藤愛、尾崎克久
    • Organizer
      日本昆虫学会第76回大会・第60回日本応用動物昆虫学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学
    • Year and Date
      2016-03-28
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] アゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚受容体遺伝子の種間比較2016

    • Author(s)
      ○尾崎克久、小寺正明、武藤愛、吉川寛
    • Organizer
      日本昆虫学会第76回大会・第60回日本応用動物昆虫学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学
    • Year and Date
      2016-03-26
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] NGSを用いたアゲハチョウの食草認識に関わる遺伝子群の網羅的探索と比較2015

    • Author(s)
      尾崎克久、小寺正明、武藤愛、吉川 寛
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 化学情報学と生命情報学の融合による群集生態学2015

    • Author(s)
      小寺正明
    • Organizer
      第38回ケモインフォマティクス討論会
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館
    • Year and Date
      2015-10-09
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 化学生態学ネットワークの理解のための昆虫ゲノム・植物メタボローム解析2015

    • Author(s)
      小寺正明、武藤愛、尾崎克久
    • Organizer
      NGS現場の会 第四回研究会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2015-07-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Sequence Read Archiveからの昆虫の植物化合物代謝遺伝子の探索2015

    • Author(s)
      武藤愛、尾崎克久、小寺正明
    • Organizer
      NGS現場の会 第四回研究会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2015-07-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 昆虫化学受容体遺伝子を見つけるためのNGS利用とTrinityアセンブルの工夫2015

    • Author(s)
      尾崎克久、武藤愛、小寺正明
    • Organizer
      NGS現場の会 第四回研究会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2015-07-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] NGSを使ったアゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚受容体遺伝子の探索2015

    • Author(s)
      尾崎克久、武藤愛、小寺正明、吉川 寛
    • Organizer
      第59回日本応用動物昆虫学会大会
    • Place of Presentation
      山形大学(山形市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-28
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Development of insect orthologue search database2014

    • Author(s)
      尾崎克久、武藤愛、小寺正明
    • Organizer
      GIW ISCB-ASIA 2014
    • Place of Presentation
      東京国際交流館(東京・お台場)
    • Year and Date
      2014-12-15 – 2014-12-17
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] ゲノム解読とRNA-seqによるアゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚遺伝子候補の探索2014

    • Author(s)
      尾崎克久、小寺正明、武藤愛
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Evolution of gustatory sensing mechanism for host recognition in swallowtail butterflies2014

    • Author(s)
      尾崎克久、龍田勝輔、小寺正明、武藤愛、吉川寛
    • Organizer
      日本進化学会第16回大阪大会
    • Place of Presentation
      高槻現代劇場(大阪府高槻市)
    • Year and Date
      2014-08-21 – 2014-08-24
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] Genome informatics platform of lepidopteran insects2014

    • Author(s)
      小寺正明、武藤愛、尾崎克久
    • Organizer
      ISMB 2014
    • Place of Presentation
      ボストン
    • Year and Date
      2014-07-11 – 2014-07-15
    • Related Report
      2014 Research-status Report
  • [Presentation] アゲハチョウ食性進化の仕組み2014

    • Author(s)
      尾崎克久、龍田勝輔、武藤愛、小寺正明、吉澤靖貴、吉川寛
    • Organizer
      第58回応用動物昆虫学会大会
    • Place of Presentation
      高知大学
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] アゲハチョウ科昆虫ドラフトゲノムの解読2014

    • Author(s)
      武藤愛、尾崎克久、守屋勇樹、五斗進、小寺正明
    • Organizer
      第58回応用動物昆虫学会大会
    • Place of Presentation
      高知大学
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] Development of a Cross-species Search Database for Insect Genes.2014

    • Author(s)
      Masaaki Kotera, Katsuhisa Ozaki, Ai Muto, Susumu Goto.
    • Organizer
      第58回応用動物昆虫学会大会
    • Place of Presentation
      高知大学
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] Development of lepidopteran insect ortholog database.2013

    • Author(s)
      Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
    • Organizer
      The 24th International Conference on Genome Informatics
    • Place of Presentation
      National University of Singapore
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] Construction of an ortholog database of lepidopteran insects.2013

    • Author(s)
      Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
    • Organizer
      第36回に本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] Development of a Cross-species Search Database for Insect Genes.2013

    • Author(s)
      Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
    • Organizer
      2013年日本バイオインフォマティクス学会年会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Presentation] チョウ目昆虫オーソログデータベースの構築2013

    • Author(s)
      小寺正明、武藤愛
    • Organizer
      NGS現場の会第3回研究会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Related Report
      2013 Research-status Report
  • [Remarks] InsectInDB

    • URL

      http://insect-plant.org

    • Related Report
      2015 Annual Research Report

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Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

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