Comprehensive identification of RNA-protein interactions based on PD-SELEX and application to RNP tool development

Research Project

Project/Area Number	25K00079
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 37010:Bio-related chemistry
Research Institution	University of Miyazaki
Principal Investigator	福永圭佑宮崎大学, 研究・産学地域連携推進機構, 准教授 (80639279)
Project Period (FY)	2025-04-01 – 2029-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help	¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000) Fiscal Year 2028: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000) Fiscal Year 2027: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000) Fiscal Year 2026: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000) Fiscal Year 2025: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Keywords	進化分子工学 / PD-SELEX / RNP / RNAアプタマー / RNA結合蛋白質
Outline of Research at the Start	RNA－蛋白質相互作用を網羅的に解読するため、自身が開発したPD-SELEX法に適用可能な「相互作用情報を遺伝的に紐付けする手法」を新たに開発する。さらに、PD-SELEX法を用いて、RNP（RNA-蛋白質複合体）ツール開発に活用されている分子パーツ: U1A-U1hpIIの結合選択性の改変を行い、生体直交性の高いRNA－RBPペアを作出する。また、U1A変異体に応答する高性能リボスイッチの開発も行う。