Development of a non-invasive stress diagnosis method for important fisheries species using environmental RNA

• Project/Area Number: 25K00090
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 40030:Aquatic bioproduction science-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 日置 恭史郎 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 講師 (10792913)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 羽野 健志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(廿日市), 主任研究員 (30621057) ; 伊藤 真奈 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(廿日市), 主任研究員 (60735900)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000); Fiscal Year 2027: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2026: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2025: ¥7,930,000 (Direct Cost: ¥6,100,000、Indirect Cost: ¥1,830,000)
• Keywords: 環境RNA / ストレス / トランスクリプトーム / クルマエビ / ウイルス感染

Outline of Research at the Start

本研究ではまず環境RNAとして検出できる遺伝子の種類とその体内起源（表皮・消化管・生殖腺など）を複数の生物分類群（魚類・甲殻類など）について調べ、環境RNAによる評価手法の適用範囲を明らかにする。具体的にはRNAの網羅的なシーケンス解析などを実施する。その後、得られた基礎情報に応じて、定量PCRなどを用いた環境RNAによる効率的な生理状態の評価方法を確立する。開発した技術は、室内・室外の水槽あるいは生け簀実験で検証する。