Structural analysis of modular PKS by combining experimental and bioinformatic science

• Project/Area Number: 25K01946
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 宮永 顕正 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (10623126)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中野 祥吾 静岡県立大学, 食品栄養科学部, 准教授 (80748541) ; 千菅 太一 静岡県立大学, 食品栄養科学部, 助教 (80980870)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2029-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000); Fiscal Year 2028: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2026: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2025: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
• Keywords: 微生物酵素 / 結晶構造解析 / タンパク質間相互作用 / クロスリンク / ポリケタイド合成酵素

Outline of Research at the Start

ポリケタイド抗生物質の生合成において中心的な役割を担うモジュール型ポリケタイド合成酵素は、複数の触媒ドメインからなる巨大タンパク質であり、多段階の反応を触媒する。本研究では、独自に開発したクロスリンク反応に加えて、AIを用いた情報科学的手法を取り入れることにより、モジュール型ポリケタイド合成酵素の全体構造を決定し、各反応段階におけるモジュールの構造変化やドメイン間相互作用の解明を目指す。