Monitoring population fluctuations of the endangered Ryukyu-ayu enabled by DNA Analyses

• Project/Area Number: 25K02038
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39060:Conservation of biological resources-related; Basic Section 39070:Landscape science-related; Sections That Are Subject to Joint Review: Basic Section39060:Conservation of biological resources-related , Basic Section39070:Landscape science-related
• Research Institution: Fukui Prefectural Satoyama-Satoumi Research Institute
• Principal Investigator: 武島 弘彦 福井県里山里海湖研究所, 研究部門, 研究員 (50573086)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 秋田 鉄也 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), 主任研究員 (60625507) ; 安房田 智司 大阪公立大学, 大学院理学研究科, 教授 (60569002) ; 久米 元 鹿児島大学, 農水産獣医学域水産学系, 准教授 (00554263) ; 山中 裕樹 龍谷大学, 先端理工学部, 教授 (60455227)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2030-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000); Fiscal Year 2029: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2028: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000); Fiscal Year 2027: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000); Fiscal Year 2026: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2025: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
• Keywords: 個体数推定 / 近親関係 / CKMR / ゲノミクス / 環境DNA

Outline of Research at the Start

絶滅危惧種の保全にて重要なのは「個体数」を信頼できる数値で把握し，モニタリングすることである．本研究の目的は，DNA 分析だけで効率的に絶滅危惧魚類の個体数を推定することにある．ゲノム情報から推定する近親関係に基づく個体数推定法「Close-Kin Mark-Recapture : CKMR 法」を，絶滅危惧魚類「リュウキュウアユ」にて実施する．環境 DNA の定量分析結果に基づく個体数推定モデルに，CKMR法の結果や河川環境データの実測値も組み込むことで，推定精度の向上を図る．最終的に環境 DNA 分析だけで個体数推定ができる方法を確立し，希少魚類保全のモデルケースを提示する．