Development of a Research Platform for Functional Analysis of Proteins Derived from Endogenous Viral Elements in Mammalian Genomes

• Project/Area Number: 25K02265
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 43060:System genome science-related
• Research Institution: Tokai University
• Principal Investigator: 中川 草 東海大学, 医学部, 准教授 (70510014)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 大塚 正人 東海大学, 医学部, 教授 (90372945) ; 北尾 晃一 名古屋大学, 生命農学研究科, 研究員(学振PD) (20991269) ; 柳谷 稜 佐賀大学, 医学部, 助教 (80825779) ; 峯岸 ゆり子 公益財団法人がん研究会, がんプレシジョン医療研究センター 分析生化学研究部, 特任研究員 (20621832)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2029-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000); Fiscal Year 2028: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2027: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2026: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2025: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
• Keywords: 内在性ウイルス様配列 / トランスポゾン / ネオアンチゲン / 遺伝子デリバリー / 比較ゲノム解析

Outline of Research at the Start

哺乳類ゲノムに存在する内在性ウイルス様配列（EVE）は、これまで無機能と見なされてきたが、近年、一部がタンパク質やペプチドとして機能することが判明している。本研究では、ヒトを含む710種の哺乳類ゲノムを対象に、EVE由来のタンパク質コード領域を網羅的に同定・機能注釈し、RNA-seqや比較ゲノム解析を通じた発現解析も行う。得られた情報は統合データベースとして公開し、EVEの研究基盤を提供する。この情報を活用し、EVEを活用した遺伝子デリバリー手法の開発や、急性骨髄性白血病（AML）に有効なネオアンチゲンの探索を進め、EVEの生物学的・医学的価値の再評価を目指す。