Elucidation of cancer transcriptome dysregulation by full-length RNA modomics

• Project/Area Number: 25K02526
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 永江 玄太 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任准教授 (10587348)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 上田 宏生 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任講師 (70821916)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2029-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥26,000,000 (Direct Cost: ¥20,000,000、Indirect Cost: ¥6,000,000); Fiscal Year 2028: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000); Fiscal Year 2027: ¥8,450,000 (Direct Cost: ¥6,500,000、Indirect Cost: ¥1,950,000); Fiscal Year 2026: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000); Fiscal Year 2025: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
• Keywords: がん / RNA修飾 / スプライシング / シークエンサー

Outline of Research at the Start

がん組織のゲノム変異・構造異常・転写制御異常（DNAメチル化）など多階層の分子プロファイリングが飛躍的に進んだなか、がん進展過程における遺伝子発現調節機構を包括的に理解する上では転写開始制御に加えてスプライシングや核外輸送と安定性、翻訳調節などを制御するmRNA修飾の重要性が認識されてきた。本研究では、研究代表者らが近年開発を進めてきたmRNA全長にわたる複数修飾の網羅的検出法をさらに発展させ、がん細胞におけるmRNAの代謝ダイナミクスとの統合解析を進めるとともに、実際のがん組織微小環境での空間動態を明らかにし、これに介入する創薬標的としての可能性までを目的とする。