横断的オミクス解析と機械学習による間質性膀胱炎の治療標的とバイオマーカーの開発

• Project/Area Number: 25K02771
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 56030:Urology-related
• Research Institution: Shinshu University
• Principal Investigator: 秋山 佳之 信州大学, 学術研究院医学系, 教授 (20529135)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 前田 大地 神戸大学, 医学研究科, 客員教授 (30585500) ; 蔵野 信 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (60621745) ; 曽根原 究人 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 客員研究員 (60975358) ; 新美 文彩 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (00376451) ; 野里 博和 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 研究チーム長 (40435764)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥12,350,000 (Direct Cost: ¥9,500,000、Indirect Cost: ¥2,850,000); Fiscal Year 2027: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2026: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000); Fiscal Year 2025: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
• Keywords: ハンナ型間質性膀胱炎 / オミクス解析 / リピドミクス解析 / 全ゲノム関連解析 / シングルセル解析

Outline of Research at the Start

本研究ではオールジャパン体制でHICの全ゲノムシーケンス解析を行い、大規模な疾患ゲノム情報を取得する。また、質量分析技術を用いて尿中脂質の網羅的測定を行い、尿中脂質バイオマーカーの同定と機械学習による尿リピドミクス診断アルゴリズムの構築を行う。続いてシングルセル解析を行い浸潤リンパ球のクローン性拡大誘導因子の探索とゲノム解析で得られた疾患感受性遺伝子の生物学的機能解析を行う。これらの横断的なオミクス解析と臨床病理学的データを統合することで、HICの病態解明や新規治療標的/バイオマーカーの発見を目指すとともに、尿検体による非侵襲的かつ高精度な診断法の開発を目的とする。