Building a foundation of 'metadata science' for omics research

• Project/Area Number: 25K03216
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
• Research Institution: Niigata University
• Principal Investigator: 吉沢 明康 新潟大学, 医歯学系, 特任准教授 (70551159)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 河野 信 北里大学, 未来工学部, 教授 (40470075) ; 山田 一作 公益財団法人野口研究所, 研究部, 室長 (50370185) ; 津川 裕司 東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (30647235) ; 加藤 雅樹 国立研究開発法人理化学研究所, 情報統合本部, 技師 (40991922) ; 高橋 悠志 新潟大学, 医歯学系, 特任助教 (50719713)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000); Fiscal Year 2027: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2026: ¥7,410,000 (Direct Cost: ¥5,700,000、Indirect Cost: ¥1,710,000); Fiscal Year 2025: ¥6,630,000 (Direct Cost: ¥5,100,000、Indirect Cost: ¥1,530,000)
• Keywords: オミクス / メタデータ / 標準化 / 機械学習 / 大規模言語モデル

Outline of Research at the Start

本研究が目指すのは、用語・記入法などがオミクス間でまちまちなメタデータの記述を標準化し、メタデータの大規模集積を可能にすることである。この目的のために、シソーラス（類義語辞書）の作成と大規模言語モデル (LLM) を用いて、類似概念のメタデータの対応づけを行う。また副次的に、メタデータ入力時点での標準化を促進するため、代表的な解析ソフトウェアなどにメタデータの一部を自動抽出する機能を付加する。
このようなメタデータの標準化によってオミクス間を超えたメタデータの突き合わせを可能にし、メタデータ自体を研究対象とする「メタデータ科学」の創始を目指す。