Elucidating Genome Diversification in Environmental Adaptation of Phages Using Single-Particle Genomics

• Project/Area Number: 25K08911
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 38020:Applied microbiology-related
• Research Institution: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• Principal Investigator: 西川 洋平 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (90867277)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2026: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2025: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: ファージ / 1粒子ゲノム解析 / ゲノム / 適応進化 / 変異

Outline of Research at the Start

本研究では、バクテリオファージの増殖過程において生じる変異株のゲノム情報の多様性を、1粒子ゲノム解析技術を用いて網羅的に解析する。これにより、ゲノムに生じた多数の変異箇所の中から、ファージの宿主適応進化において重要な役割を果たす変異を効率的に特定する。また、特定の変異のみを有するファージを用いて宿主細菌への感染実験を行うことにより、特定した変異がファージの宿主感染能に与える影響を実験的に証明する。