Elucidation of formative factors for active 3D structure of curacomycin, a cyclic peptide with antimicrobial activity

• Project/Area Number: 25K08943
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 38040:Bioorganic chemistry-related
• Research Institution: Mie University
• Principal Investigator: 増田 裕一 三重大学, 生物資源学研究科, 准教授 (90617755)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 池上 貴久 横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (20283939)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2026: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2025: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: 環状ペプチド / 三次元構造 / 核磁気共鳴 / 構造活性相関 / 標的分子探索

Outline of Research at the Start

本研究では『環状ペプチドの活性発現に係わる三次元構造は、どのような構造的要因により形成されるか』を学術的「問い」とし、その解明につながる知見を得る目的で、抗菌環状ペプチドcuracomycinに含まれる特殊アミノ酸が、三次元構造形成および標的分子認識においてどのような役割を果たしているかを、原子レベルで解明する。具体的には、curacomycinの三次元構造を核磁気共鳴で解析し、構造活性相関を三次元構造の観点から明らかにする。さらに、curacomycinの分子プローブを用いたアフィニティ精製により標的分子を同定し、リガンド－タンパク質のドッキングシミュレーションにより結合様式を解明する。