進化的特徴へのゲノム情報解析とAI技術を用いた病原性・共生遺伝子群の発見法の開発

Research Project

Project/Area Number	25K09119
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 39040:Plant protection science-related
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	青木誠志郎東京大学, 大学院総合文化研究科, 特任研究員 (10334301)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	松井求京都大学, 化学研究所, 助教 (10803728) 晝間敬東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (20714504)
Project Period (FY)	2025-04-01 – 2030-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help	¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000) Fiscal Year 2029: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000) Fiscal Year 2028: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000) Fiscal Year 2027: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000) Fiscal Year 2026: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000) Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords	植物微生物相互作用 / 進化 / ゲノム / バイオインフォマティクス / 寄生と共生
Outline of Research at the Start	植物ー微生物相互作用における病原性・共生遺伝子の研究は、今まで主に現象から遺伝子を特定する順方向の遺伝学的手法が主流であった。しかし近年、生物のビッグデータ蓄積に伴いゲノムや生態情報から生命現象を解明する逆方向アプローチの重要性が増している。本研究では、糸状菌と根粒菌において発見された遺伝子群の進化的特徴を出発点とし、以下の解析を行う： 1. 遺伝子群の進化・生態・構造的特徴の解明 2. バイオインフォマティクスを用いた新規病原性・共生遺伝子の予測法の開発 3. 植物病理学的実験による機能検証 4. 新たな植物保護手法の提案これらの解析により、情報から現象への新しい生物学的アプローチの確立を目指す。