Using AI technology to determine genetic contamination of Boso Japanese macaques. - Considering speciation from hybridization issues.

• Project/Area Number: 25K09164
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39060:Conservation of biological resources-related
• Research Institution: University of Hyogo
• Principal Investigator: 森光 由樹 兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 准教授 (20453160)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 山田 一憲 大阪大学, 大学院人間科学研究科, 講師 (80506999)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥130,000 (Direct Cost: ¥100,000、Indirect Cost: ¥30,000); Fiscal Year 2026: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2025: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
• Keywords: 外来種 / 交雑 / AI分析 / ニホンザル / 種分化

Outline of Research at the Start

房総半島に外来種アカゲザルの生息が認められ、在来種ニホンザルに遺伝子汚染が確認された。交雑個体は、遺伝学的手法、形態学的手法において識別法が開発されている。しかし、ニホンザル生息域において、どの程度交雑が進んでいるのか科学的情報は乏しい状況である。本研究は既存のデータ（房総ニホンザル、アカゲザル、交雑個体の画像と遺伝データ、形態データ）を用いて人工知能（AI）による交雑個体判定法を開発しその精度を検証する。そして、ニホンザルの群れの交雑率を算出する。また、海外の霊長類で起きている種間交雑の機構と霊長類の種分化仮説について房総サルの交雑資料を利用し仮説を検証する。