Analysis of DNA replication regulation and chromosome architecture conferred by Rif1 multimer formation

• Project/Area Number: 25K09520
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 43010:Molecular biology-related
• Research Institution: Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science
• Principal Investigator: 加納 豊 公益財団法人東京都医学総合研究所, 基礎医科学研究分野, 主席研究員 (90450593)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: Rif1 / DNA複製 / 染色体高次構造

Outline of Research at the Start

Rif1には、多量体を形成し、結合部位から約100kbにわたる広範囲のDNA複製を抑制する能力があると予想されるが、その作用機序は未だ解明されていない。本研究では、Rif1の多量体形成変異体を選別し染色体結合、複製タイミング、染色体高次構造に与える影響を明らかにすることを目的とする。そのために、ChIP-seq（Rif1の染色体結合解析）、EdUIP-seq（DNA複製解析）、Hi-C（染色体の三次元構造解析）、Nanopore-DamID-BrdU解析（Rif1の染色体結合部位と複製の1分子DNA同時解析）等の解析手法を用いて解明する。