Development of an Algorithm for Detecting Time-Series Changes in Homeologs Contributing to Environmental Tolerance in Wheat Plants

• Project/Area Number: 25K09719
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 45010:Genetics-related
• Research Institution: National Agriculture and Food Research Organization
• Principal Investigator: 孫 建強 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 農業情報研究センター, 主任研究員 (90838624)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2027: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2025: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
• Keywords: 発現量解析 / 異質倍数体 / 小麦 / ホメオログ

Outline of Research at the Start

異なる種の交雑で生まれた異質倍数体は、環境の変化に強く、品種改良に役立つと期待されている。その強さは、異なる親から受け継いだ重複遺伝子（ホメオログ）が異なる働きをすることに由来すると考えられており、仕組みの解明が求められている。従来の手法では、たとえば処理群と対照群など2時点での違いは捉えられるが、偽陽性が多く、時間に伴う変化を正確に見るのが難しかった。本研究では、偽陽性を抑えながら、環境の変化に応じてホメオログの発現比が時間とともにどう変わるかを捉える新しい手法を開発し、コムギの環境耐性の仕組みを明らかにすることを目指す。