Genome Instability mediated by Mesoscale DNA Structures

• Project/Area Number: 25K10477
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 50010:Tumor biology-related
• Research Institution: Fujita Health University
• Principal Investigator: 稲垣 秀人 藤田医科大学, 医科学研究センター, 講師 (70308849)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2027: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: ゲノム不安定性 / ナノポア

Outline of Research at the Start

がんや先天異常の原因となりうるゲノムの不安定性はDNAの高次構造が引きがねになることが知られており、それにともなう複製エラーやDNAダメージに対する研究が進んでいる。またこれらをターゲットにした治療や予防法の開発が視野に入れられる。本研究では、このようなDNAのメソ（中間）スケールの特殊な高次構造に着目し、既知のパリンドロームやグアニン四重鎖などの二次構造に加え、ヒトゲノム中の未知のDNA高次構造をナノポアシーケンサーを用いて同定することを目指す。そしてその高次構造のゲノム中の分布と、実際のゲノム不安定性を引き起こす領域を対比し、その不安定性の発生機序を解明する。