空間的かつ1細胞レベルで解明する腸内細菌叢による食道がん微小環境の創出機構

• Project/Area Number: 25K12030
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 55020:Digestive surgery-related
• Research Institution: Kyushu University
• Principal Investigator: 大渕 昂 九州大学, 大学病院, 医員 (51012398)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 三森 功士 九州大学, 大学病院, 教授 (50322748) ; 岩槻 政晃 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 教授 (50452777)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2027: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2026: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000); Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
• Keywords: scRNA / VISIUM / 統合解析 / 腸内細菌 / 腫瘍免疫

Outline of Research at the Start

本研究においてわれわれは一細胞レベルでのトランスクリプトーム情報(scRNA)や空間情報を伴う遺伝子発現プロファイル(VISIUM)を用いた深層学習を用いた数理統計学的解析を行いFusobacterium.nucleatumの感染の局在と、特に癌代謝機構の破綻に関連する食道発癌のメカニズムを解明する。さらに治療や予防に向けた標的因子を同定する。既にわれわれは大腸癌におけるVISIUM解析で治療標的を同定した実績があり、本研究の実験および数理統計学的解析も同じチームで実施する。