ゲノム配列上のポリプリン/ポリピリミジン配列を利用したウイルス同定法の創出

• Project/Area Number: 25K13538
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
• Research Institution: Toyama Institute of Health
• Principal Investigator: 安川 和志 富山県衛生研究所, 化学部, 主任研究員 (00737835)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2025: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
• Keywords: アデノウイルス / ポリプリン配列 / 遺伝子型別 / 三本鎖DNA

Outline of Research at the Start

本研究は, ウイルス感染症の早期診断・治療の方向づけをするための, ウイルス感染症の迅速な鑑別法の開発を目指すものであり, 二本鎖DNAウイルスであるアデノウイルスをモデルとして実施する。具体的には, 以下について検討する。
①全ゲノム配列が解読されているウイルスを対象に, ゲノム上に分布するポリプリン/ポリピリミジン (PolyRY) 配列の位置情報と出現する配列パターンからウイルスの同定および遺伝子型別法に利用できるか検討する。
②上記, PolyRY配列は, 三本鎖DNAを形成することが知られている。そこでPolyRY配列を三本鎖DNAの形成を利用して高感度に検出する新たな手法を検討する。